利用同程供水系统来设计的同程底滤很好的解决了这个问题，每根导流管到进、出水口的流程都是相等的，导流孔的流程差只有65mm，可以做到整个底砂部分的均匀进水，而不必担心水流短路的问题。
同程式底滤又分正吸和反冲两种水循环方式，正吸就是指同程式底滤起到进水口的作用，而反冲则刚好相反是起到出水口的作用。
二、滴流式过滤（滴滤）
滴滤是个集成的过滤器，是对上滤的升级扩建，它将物理过滤与生物过滤合在一个过滤槽中，过滤槽中分成几层，（具体层数可以根据需要增减）过滤槽的上层为物理过滤室，主要放置有过滤棉、生化棉，下面几层分别放置生化球、藤棉、玻璃环、石英球、细菌屋等各种滤材。当水流通过时会增加与空气的接触面从而增加容氧量，为好氧性细菌提供最理想的生存环境。
优点：物理生化过滤完善、过滤效果较好。
缺点：占用水族箱的上部空间、在一定程度影响水族箱的美观、如处理不好则水流的声音会相对较大。
三、上部过滤器（上滤）
上滤是放置于水族箱上面，潜水泵将水抽入上滤槽内，水流通过过滤棉、生化棉、各种滤材后再由底部的出水管流回到水族箱内。
优点：价格便宜、结构简单、清洗和维护都很方便。由于在鱼缸上部，对过滤器的维护非常方便；可以将缸内不太理想的水质从鱼缸内物理隔离开来，大大减少鱼缸有机物含量，降低生物过滤的压力，这点是其他方式的物理过滤所不能代替的。
缺点：占用鱼缸上面空间、影响水族箱的美观度，内部空间有限放置滤材相对较少从而生化过滤效果一般，但不利有益菌生长。另外，由于上滤过水面积大、水流湍急会增加CO2的逃逸，如果是喷淋进水的话将更严重，因此不适于种植水草的水族箱。
四、流沙过滤器
流沙过滤器（又称流沙床过滤器、沙樽过滤）传统过滤中，固体滤材基本上是以互相堆积，密度紧密堆积作为渗透层。但流沙过滤器不同，流沙过滤器的结构非常简单，由一个密封圆筒，内置1/3的细沙所构成，采用外挂或悬挂式。操作时，循环水从圆筒下端输入，从上端输出。水流强度只允许细沙在圆筒内产生搅动。但不会随水流进入水族箱。
它的滤材是以颗粒状滤材作为填充层，循环水从下方连续冲激填充层，让颗粒状滤材呈浮动状态，流沙过滤器可以称得上是一个纯粹的生物过滤器，因为它没有物理过滤功能，所有的有机杂质必须靠微生物固体表面形成的异养性生物膜来分解，因此它的滤材同时具有消除有机杂质，及硝化作用双重功能。
适用范围：适用于各类水族箱，海鲜池的过滤及水循环，水族宠物及养殖用水的过滤净化等。适用于水草缸及礁岩缸。
优点：单位体积下比同体积的石头表面积多1000倍、水流使培菌砂充分搅拌滚动，溶氧量高，完全无死角、培菌砂不停的滚动，可不断地促进整个硝化细菌菌群的新陈代谢、免清洗、免更换滤材，维謢工作简单经济、寂静无声、不占空间，安装简便、迅速、机动性强，拆装容易、可随时支持新缸或危险状态缸的抢救工作。
缺点：基本无物理过滤功能，不能独立完成过滤工作、进入流沙过滤的水流需要先经过物理过滤否则容易阻塞。
五、侧滤和背滤
侧滤和背滤是在鱼缸的背部或侧部用玻璃隔出一部分做过滤，其内部分成几小格用于放置滤材和循环泵，一边设有溢流口，当水泵把水从过滤部分抽向鱼缸时，鱼缸溢出的水通过溢流口流入过滤部分的第一格，在隔板的引导下流经各种滤材，水从最后一格通过水泵再次送入鱼缸形成循环。
优点：利用鱼缸的内部空间使鱼缸和过滤形成一个整体，不需另外利用其它缸外位置就可以完成较好的过滤流程。一些器材可以在侧滤/背滤放置，适当放置不影响鱼缸的正面视觉美感。
缺点：占用了鱼缸的部分空间，缸内的空间会减少、受鱼缸宽度或长度的限制，放置过滤材料也受限制、水分的蒸发会引起水泵所在间隔的水位较快降低，需要频繁补水。
六、底缸过滤（底滤）
底滤是利用一个放置于底柜的大型滤槽（称为底缸），通过管道与主缸连接，利用水泵来完成水的循环，滤槽根据尺寸及实际需要分为若干格，用来分别放置不同的滤材或器材，底缸过滤一般采用溢流的下水方式，在形式上分为三角溢流、方形溢流、圆形溢流、三重溢流管溢流、不打孔溢流等多种形式。
优点：物理生化过滤完美搭配、增大了整个系统的水体，更有利于保持水质的稳定。底缸空间较大可以放置更多的过滤材料。底缸有更多的空间可以放置各种器材，使主缸更整洁美观。换水等操作可以在底缸进行，有效减少对缸内生物造成的影响。
缺点：主缸水位不易调解、结构复杂，制作成本较高、下水调解不当容易产生噪音、容易造成底柜潮湿、水泵扬程变长功率也会相应增大，耗电量也会增加。
七、外置过滤桶式过滤
外置过滤桶式过滤是一种密闭的过滤形式，桶内部分为若干层，每层都可以放置不同的过滤材料，利用桶内部或桶外部的水泵使水族箱中的水不断流经桶内的各层滤材，从而达到循环过滤的目的。启动前一定要保证桶内及进出水管满水避免有空气积存。
优点：占用缸内空间较小、噪音较低、生化过滤效果好、安装较灵活多样、出水可以帮助造流。
缺点：物理过滤效果较弱、清洗启动较繁琐、进出水管道容易造成凌乱。
八、外挂过滤器（瀑布过滤器）
瀑布过滤器是一种挂在缸壁上使用的半封闭式过滤器，内部设有不同的滤材摆放区域，利用机身自带的水泵将水族箱内的水吸入过滤器内部并流经各种滤材，达到循环过滤的目的，然后水流从出水口以瀑布形式流回鱼缸内。
优点：价格低廉使用简便，在缸壁上挂好即可开始工作、不占用缸内空间、噪音相对较小。
缺点：由于受到自身体积和内部空间的限制，滤材的放置量比较有限、过滤效果一般不适宜用于大型鱼缸、带有拉筋的水族箱及成品缸可能无法使用，比较适合用于小型草缸、养鱼不多的小型裸缸，出水水位高度无法调节，将水位调制与瀑布过滤器的出水口齐平最佳。
九、内置式过滤器
内置过滤器是泵与过滤盒连接在一起并安置在水中使用，在过滤盒内部安放有各种滤材（一般以生化棉为主），用于培菌。
优点：使用简便容易安装、水流方向可以根据需要随意调节、适用于以水草为主的小型水族箱。
缺点：占用一定的缸内空间、由于安置在水中导致过滤到的污物长期滞留在水中，对水体造成二次污染、清洗时需要从水中取出会造成大量的污物重新回落到缸内、过滤效果有限很难独立完成过滤工作。
十、潮汐式过滤
优点：模仿自然“潮起潮落”，使硝化细菌活得更好、能给鱼缸更有效地增氧、节能，相对其它过滤方式来说，潮汐过滤不需要较大功率的过滤泵。
缺点：噪声，这应该是潮汐过滤最大的缺点了、形成潮汐要有一定经验，初学者不好掌握。
十一、水妖精
水妖精是一种小型的成品气举过滤器，用气泵驱动，利用气泡在水里上升时产生的提水作用，功率和效率都很小，是繁殖缸常用的小东西；也是内置的一种。小型缸适用，大缸可以作辅助过滤器。工作原理是出气口出气，向上带动水流上升，周围水流不断从圆柱海绵体的外面向内补充，这样就给附着在圆柱海绵上的硝化细菌提供了含有氧气的水和硝化菌生存所需要的营养（鱼类的排泄物所转化的氨及亚硝酸盐）。于是硝化菌就在海绵体表面和内部着床了，从而起到了生物过滤的作用。
优点：加氧、生化过滤一次完成，不会对鱼虾造成冲击。简洁、高效、使用方便、经济、效果立竿见影！
缺点：占用缸内空间、由于使用气泵驱动工作时会产生一定的噪音、只适用于尺寸较小的水族箱中，如繁殖缸、小型虾缸等、多用于辅助培菌很难独立完成过滤工作。
十二、气举与反气举
气举:
在容器底部的气石出气,气泡上升,带动水流,给容器里面的玻璃环等滤材同时带来空气和水流。硝化菌过滤掉水流中的杂质，空气提供给需要氧气的硝化菌使用。
反气举：
内部构造和气举基本一样，底部的吸水口变成了出水口。反气举一般放置在上滤的出水口下方，接受上滤的下落出水。而且反气举是大型敞口，高于水面。这样使得上滤的排水全部进入反气举。水流带有一定压力（因为开口高于水面）从反气举下面的排水口出来。底部的气石同时造成上升气流。这样陶瓷环可以同时被下降水流和上升气泡影响。由于下降的水流大大高于单纯气举的上升水流量，所以反气举内部的玻璃环等滤材生化过滤的效果要高于单纯气举。