药食同源目录是从事大健康食品代加工生产行业众多厂家的参考依据。从1987年出现，到2023年新增加党参等9种物质，已经扩增到102种。药食两用物质的广泛应用，加速了片剂、粉剂、颗粒以及茶包等各种剂型对应的新品上市，也使得压片糖果、固体饮料、代用茶等产品的OEM贴牌加工更为灵活。
2022年，卫法监发[2002]51号：既是食品又是药品的物品名单(87种)
丁香、八角香、刀豆、小茴香、小蓟、山药、山楂、马齿览、乌梢蛇、乌梅、木瓜、火麻仁、代代花、玉竹、甘草、白芷、白果、白扁豆、白扁豆花、龙眼肉(桂圆)、决明子、百合、肉豆蔻、肉桂、余甘子、佛手、杏仁(甜、苦)、沙棘、牡蛎、茨实、花椒、赤小豆、阿胶、鸡内金、麦芽、昆布、枣(大枣、酸枣、黑枣)、罗汉果、郁李仁、金银花、青果、鱼腥草、姜(生姜、干姜)、枳椇子、枸杞子、栀了、砂仁、胖大海、获苓、香橼、香薷、桃仁、桑叶、桑葚、桔红、桔梗、益智仁、荷叶、莱菔子、莲子、高良姜、淡竹叶、淡豆鼓、菊花、菊苣、黄芥子、黄精、紫苏、紫苏籽、葛根、黑芝麻、黑胡椒、槐米、槐花、蒲公英、蜂蜜、榧子、酸枣仁、鲜白茅根、鲜芦根、蝮蛇、橘皮、薄荷、薏苡仁、薤白、覆盆子、霍香。
注：国卫办食品函【2014】975号将槐米和槐花归到一种，所以也会有部分药食同源目录统计了为86种。
2014年，国家卫生计生委办公厅关于征求《按照传统既是食品又是中药材物质目录管理办法》(征求意见稿)意见的函(国卫办食品函〔2014〕975号)，但只是意见稿，没有正式发布，不能作为使用依据。
人参、山银花、芫荽、玫瑰花、松花粉、粉葛、布渣叶、夏枯草、当归、山奈、西红花、草果、姜黄、荜茇，油松。(在限定使用范围和剂量内作为药食两用)
2019年，《关于当归等6种新增按照传统既是食品又是中药材的物质的公告》，药食同源目录新增6种物质。(仅作为香辛料和调味品使用)
当归、山奈、西红花(藏红花)、草果、姜黄、荜茇
2019年，《关于对党参等9种物质开展按照传统既是食品又是中药材的物质管理试点工作的通知》，对9种物质进行“开展生产经营试点工作”。
党参、肉苁蓉(荒漠)、铁皮石斛、西洋参、黄芪、灵芝、山茱萸、天麻、杜仲叶(在限定使用范围和剂量内作为药食两用)
2023年11月17日，《关于党参等9种新增按照传统既是食品又是中药材的物质公告》，药食同源目录再次“党参、肉苁蓉(荒漠)、铁皮石斛、西洋参、黄芪、灵芝、山茱萸、天麻、杜仲叶”增加9种物质。