水对于维持动物的生理和生化过程是必不可少的，因此也是维持生命所必需的。水存在于所有的组织和细胞中，是细胞内和细胞外进行生理过程的介质。
我们需要根据实验动物的需求，给动物提供适合饮用的、未被污染的饮用水；除了有试验特殊的需求，动物在任何时候都应该能够获取饮用水。
水源水污染物包括以下几类：重金属、有机和无机化学品、杀虫剂和除草剂、病原体和放射性核素。
尽管交付给研究机构的饮用水产品的质量可能足以供人类饮用，但其质量可能不足以供实验动物饮用。因为一定浓度的饮用水消毒剂副产物往往是不受欢迎的，且会引入意外变量，从而混淆动物实验结果，也会对动物健康产生不利影响。
从监管的角度，国标和Guide对水质的指南和标准都做了定义和要求。对于开展临床前服务的机构，GLP的监管机构都明确要求机构对水质进行定期的质量评估。法规要求的目的是确保已知能够干扰研究的污染物不会对动物产生不利影响，并不处于或高于能够干扰研究结果的水平。考虑到饮用水供应的复杂性和多变性，对水源水质的评估是确定最终动物饮用水安全和决定是否需要额外处理的关键步骤。
有很多种方法可以用于饮用水的处理或纯化，但是每种方法都有其优缺点。这些方法可以作为独立的处理系统供整个设施所需，也可以结合使用位点、逐层或逐栋建筑物设置。水净化系统的设计是为了去除水中的微粒，以及化学和生物污染物。
处理动物饮用水最常用的机械净化方法包括过滤、辐照和蒸汽灭菌。
过滤系统在设计和功能上有很大的不同，反渗透（RO）系统产生的产品因“没有微粒、化学和生物污染物”，因此要比其他过滤系统要纯净得多。
辐照和蒸汽灭菌是处理生物污染物的方法，但无法去除化学污染物，因此可被用作辅助水处理选项。
酸化和氯化作为处理生物污染的化学方法也是如此。尽管氯化和酸化是研究设施中广泛使用的有效水消毒方法，但会因某些类型的研究需禁止添加化学添加剂而无法使用。此外，氯化和酸化还可能会与某些水污染物反应产生有毒的消毒剂副产品，这些副产品可能对动物健康有害，并引入影响实验结果的研究变量。
考虑到很多处理方式有可能导致生理参数的改变、饮水量的下降、肠道菌群的改变或影响试验结果，必须谨慎选择饮用水的处理方式。重要的是要充分了解水处理方案和供水系统，以便让主要研究人员了解其实验室正在进行的研究类型，并讨论可用的水处理方案以及制定最适合满足其具体需要的解决方案。