这是根据医保报销时的药品目录来区分的，甲类一般指临床所需要的甲类药品，这些要药品使用比较广泛，疗效好价格低在报销时一般100%都是按报销政策报销的。
而乙类医保就是指乙类药品，这类药品一般是用于临床治疗选择，并且价格一般比甲类药品高，同时疗效更好的，这些是可以用基本医疗保险基金支付部分费用的，使用该类的药品在经过基本医疗保险基金的支付后列入一定比例，由被保险人自行支付。
区别是报销的药品和比例不同。
甲类医保报销甲类药品，乙类医保报销乙类药品。
甲类药品一般是临床必需、国家统一制定同时价格相对较低的，一般为OTC红色标识；乙类药品则是临床治疗中供选择的、价格也相对较高的，一般是OTC绿色标识。甲类一般只在要点销售，乙类则可以在药店和一些企业销售。
一般甲类医保报销甲类药物是可以全额报销的，而乙类医保报销乙类药品只能报销一部分，这也是医保政策的规定，更加注重基本医疗的保障，如甲类药品的报销。
甲类药品的报销比例一般是在扣除一些必要项目后按100%报销的，而乙类药品则只能报销70%到80%，此外自费药还需要最近全部承担。
可以看到，甲类医保的报销比例更高，大部分情况下是可以100%报销的，而乙类医保只能报销70%到80%，并且还不包括自费药。
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