现在消化系统疾病的死亡率呈上升趋势，petct作为一种新的影像技术，在消化系统中的诊疗中发挥着越来越重要的作用。在原发灶诊断方面由于消化道内存在较多的正常或非肿瘤因素FDG摄取，容易造成假阳性。对于消化道息肉和恶性肿瘤，如果息肉无典型形态学表现或恶性肿瘤未侵及管壁，petct很难将二者区别开来。
petct检查不出哪些癌症早期表浅的肿瘤以及部分含黏液成分较多的肿瘤因FDG摄取较少，容易呈假阴性。故对于消化道肿瘤，与内镜相比较，petct在这方面并无优势，特别在早期肿瘤的诊断方面，更多需依赖内镜。但对于内镜暂不能到达区域，如小肠，petct有很好的效果。
petct在诊断消化系统肿瘤的N分期及M分期方面有明显优势，超声、CT、MRI对淋巴结是否转移主要是依赖于其大小，对于那些小的转移性淋巴结无法诊断，petct则弥补了这一缺陷。对于那些密度或信号无明显改变的远处转移，petct可以很好地显示。petct全身扫描还可以发现临床未怀疑的其他远隔脏器或组织转移。很多病人因petct检查而改变了治疗方案。
petct俭查结果还可以直接用于放疗定位，病灶靶区体积可以通过petct提供的信息进行调整。如果怀疑有消化道肿瘤，可以先行胃镜或者肠镜检查，确诊之后可以行petct检查，以协助肿瘤分期及治疗方案的选择，治疗之可以再行petct以观察疗效，后期则以petct结合胃镜复查。
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