绝对禁忌症——身体内装有心脏起搏器及神经刺激器者严禁扫描，并避免进入磁共振检查间；体内存有动脉瘤夹，眼球内金属异物者应禁止扫描；高烧患者应禁止扫描。
相对禁忌症——如体内的金属异物(假牙、避孕环、金属植入物、术后金属夹等)位于扫描范围内时，应慎重检查，可能会因为金属物运动或产热造成损伤，金属物亦可产生伪影而妨碍诊断；昏迷、神志不清、精神异常、易发癫或心脏骤停者严重外伤、幽闭症患者、幼儿及不配合的病人应慎重扫描；需要在医生或家属监护下进行；孕妇和婴儿应征得医生同意再行扫描。
核磁共振检查过程中注意事项
1.禁止携带铁磁性物品
铁磁性物体靠近MR磁体时，由于受超高场强磁场吸引而获得极高速度飞向MR磁体，可对患者及周围人员造成灾难性甚至致命性伤害，对设备造成重大损害。千万记住禁止携带如轮椅、担架、车床、剪刀、镊子、钥匙、硬币、发夹、手表、手机、皮带、银行卡、磁卡、钱包、助听器、别针、指甲刀、小刀、打火机，能摘下的假牙、发卡、眼镜、头饰、金属首饰、皮带、氧气瓶、金属扣及金属拉链的衣服、磁疗内衣、磁疗护腰、磁疗护膝、文胸、磁贴膏药、雨伞等物品进入检查室。
2.检查过程中不要乱动
3.提前做好心理准备
√核磁共振设备内部的空间比较狭小，可能会令人产生压抑感。
面对这些问题，受检者应提前做好心理准备。检查时，放松身体、保持耐心即可。
我们磁共振检查可以大致分四部分，不同部位注意事项不同：
1、头颈部：
当然磁共振检查第一个要求就是“不要动”，因为任何一个动作都可能会引起检查部位出现运动伪影，从而影响图像。这里几个特殊部位的检查需要特别强调的
眼部MR：最好检查之前训练一下：双眼向前看，再闭眼，保持眼球不动也不要一下闭眼一下睁眼。
口腔、咽喉、腮腺、甲状腺等颈部MR：受吞咽、呼吸运动影响较大，检查时应做到平静呼吸，不要深呼吸，同时不要做吞咽动作（这个可以在检查时让检查医生提示可以吞咽的时刻，但次数不能多）。
颞颌关节张闭口MR：检查前进行闭口的训练，和不同程度张口的训练，张口一般会用开口器或用无菌纱块来代替。
2、胸部：
乳腺检查：患者做好俯卧40分钟的心理准备，和平静呼吸的训练，避免深呼吸。
心脏检查：做好屏气训练，因为心脏检查屏气的次数非常多，且屏气的幅度应该尽量一致；心率太快者必要时进行药物干预。
3、腹部：
上腹部检查时应禁水，因为饮水会造成胃里水的信号太亮而影响观察。再者要进行呼吸训练和屏气训练。下腹部、盆腔及生殖器检查应先排空膀胱，进行平静呼吸的训练，避免深呼吸。