2.在检查过程中，病人自主或不自主的活动可引起运动伪影，影响诊断,尤其是胸部及腹部MRI会存在运动伪影干扰，不适用于急诊及危急重病人，因此看肺部炎症、肺部肿瘤、腹部肝胆脾胰及淋巴结等实质性脏器行CT检查更合适；
3.由于MRI机器相当于一个巨大的磁铁，因此有心脏起搏器、体内有钢板或者其他金属材质异物的患者均不能行MRI检查。
4.MRI软组织分辨率高于CT，但它的空间分辨率不及CT。
5.由于钙化灶、结石及骨皮质不含氢质子或者含量极少，MRI对钙化、结石及骨皮质不敏感，故不能产生足够的MRI信号。
因此，在临床上，CT仍发挥着巨大的作用，CT在急诊的颅脑外伤，脑出血、肝脾破裂、肺肾挫伤、主动脉夹层、主动脉瘤等诊断中及其重要，能够快速检查，让医生快速作出诊断。64排CT可以对全身各个部位的血管进行检查，如头颈部血管成像、主动脉成像、肺动脉成像、下肢血管成像、冠脉成像与冠脉造影比毫不逊色。还可以进行仿真结肠镜及仿真支气管镜检查。
总之，CT在各个科室的疾病诊断中不可或缺，MRI不可能完全替代CT检查。
作为一名放射科医生，这两种检查我们再熟悉不过，首先想替CT喊个冤，虽然CT检查是存在辐射的，但是随着CT技术的发展，设备越来越先进，人们做一个CT检查所接受的辐射剂量也越来越小。其次，辐射对身体是有一定的危害性，但是受检者并不是长期或大剂量受照射，所以做一次CT检查就致癌的概率小之又小，所以，CT检查并没有大家想的那么可怕。
另外，核磁检查受线圈的局限，并不能进行快速的全身扫描，对于一些临床的特殊需要，不能很好的满足；还有核磁的层厚较CT厚，一些微小的病变存在漏诊风险。
总结起来，两种检查各有各的好，不能相互取代。根据临床需要，做最适当的检查，得出最准确的诊断是影像学检查最大的意义。
磁共振（MRI）有很多优势，对中枢神经系统,脊柱,腹部,子宫,前列腺,小关节,以及软组织的分辨率高，对病变检出率高。
MRI并不是适用于所有病人:
1,金属置入术后，心脏起搏器是MRI的绝对禁忌症，血管支架,骨折术后固定钢钉现在很多材料都是钛合金材料，没有磁性，但金属材料在磁场中会发热，不利于伤口愈合；
4,幽闭恐惧症病人及怀孕期者不适用于MRI；
对颅脑外伤病人的脑出血及外伤骨折检出率高。
对肺部的病灶检出率高。
随着技术的发展，低剂量CT技术的运用越来越广泛，辐射剂量也越来越小，只要不频繁做CT，对人体的影响是很小的。
在选择检查方式前还是要结合自身情况，根据医生建议来选择适合自己的检查。
首先，之所以大家都在说CT伤害大，无非就是因为其电离辐射。但是，有句话叫做，脱离剂量谈毒性都是耍流氓，电离辐射的危害同样如此。
在我们的生活中，辐射是无处不在的。一般来说，辐射分为两种，一种是手机，微波炉等家用电器导致的电磁辐射，这种辐射的危害请放心的忽略。另一种叫做电离辐射，这是由放射性物质引起的，而CT检查就需要暴露在电离辐射中。
但是，除了CT检查，我们的生活中，本身也会面对本底辐射。这是由于，我们的空气中，土壤中，水源中，放射性物质无处不在，这些放射性物质所导致的基础辐射量较徐敏本底辐射。本底辐射的剂量，只要一年不超过2.4msv一般不会对人造成伤害。
而除了本底辐射以外，国家对于普通人一年所能承受的辐射上限也作了规定，一般是1.0msv，而这也刚好是一场CT的放射剂量。而现在随着低剂量CT的出现，只会越来越安全。
最后，不同于普通人，对于放射从业人员，国家规定的辐射上限为50msv。。。换言之，这个范围以内，都可以理解为不会对人体造成健康的影响，而且这个剂量，普通人也是万万接触不到的。
主要有这么几个原因。
解释一下这两个词。
空间对比，是外科大夫最在意的事情，也就是一个瘤子长在什么位置上，肺的炎症重不重，有没有钙化的淋巴结，和周围的大血管什么关系，周围有几根比较危险的血管手术中要注意。
一个有经验的会看片子的外科大夫，可以一眼扫下CT，就能在大脑当中重建出这些信息，甚至能够设计出手术的最佳方式，切口的最佳位置，手术中的难点等等。
软组织对比，主要是看肿瘤和血管是否在细微的结构上是否有侵犯，主要是看肿瘤和临近的软组织各自的包膜是不是完整，对于困难的手术能提供一定的参考价值。
然而核磁的增强并不能够像CT的增强一样，把血管打亮，因此在手术的参考价值方面，核磁并不是必备的，但是CT是必备的。
（这是核磁，是不是比CT显得模糊一些？）
CT就像是用相机拍一张照片，非常清楚，而且一按快门就出来，很快捷。唯一不同的是CT有一定的辐射，虽然对大部分人都不会造成任何长期严重的损害。
核磁虽然没有辐射，但是需要做大概二十分钟，而且需要在一个很吵的机器里面一直待着，有些幽闭恐惧症的患者就无法配合，身体里面有金属的患者也不能进行核磁检查。
外科医生的训练一般是由CT开始的，知名的老专家也都是只会看CT，而自打上学的时候就没有学习过核磁怎么看，因此在核磁上的一些特点他们也并不熟悉。所以老师不会看，学生就更不会看了。另外CT已经非常清楚了，让所有人进行统一的检查，更有利于临床工作，和科研工作的开展。
磁共振是将人体置于特殊的磁场中，引起氢原子核共振，并吸收能量。在停止射频脉冲后，氢原子核按特定频率发出射电信号，并将吸收的能量释放出来，外部传感器接受能量信号，经计算机处理生成图像。
CT利用X线围绕人体的某一部位作从多个角度进行照射，经过计算机分析得到组织的断层图像，克服了普通X线检查组织影像互相重叠的问题。
1CT检查速度快，检查一个部位大约只需要1分钟。而磁共振至少需要30分钟以上。如果用于急救和多部位扫描，CT快速方便的优势就更为明显。一般医院CT室都是24小时值班，而磁共振室检查没有夜诊，需要预约排队。
2CT价格便宜。磁共振机购置和维护成本远远高于CT机，而且由于检查速度慢，患者数量相对要少得多，平摊成本也会更高。虽然随着技术的普及，其检查价格将来会越来越低，但是目前来说，CT检查价格还是有明显的优势。
3某些部位和疾病的检查，CT比磁共振更清楚。肺部病变，骨骼病变，脑出血，胃肠道检查。CT比磁共振的效果都更好。冠状动脉的CT造影扫描，目前磁共振还不能替代CT检查。CT增强扫描对于判断发现血供丰富的肿瘤，也比磁共振更有优势。
5CT和磁共振的影像有时需要互为补充。由于成像原理不同，CT和磁共振形成的影像并不是一样的。同一个病变在两种检查方法下，会呈现出不同的特点，这对于我们判断病变的性质是更有帮助的。这也是为什么有时医生要求两种检查都要做。
磁共振相对CT检查的优势，主要在于对软组织、肌肉、神经组织等解析度更高。而X线对于这些组织穿透力过强，所以分辨能力要差一些。而CT机的主要优势在于适用范围更广、检查速度快，价格更低、普及率更高。CT机的辐射量也没有大家想得那么可怕，肯定是在安全的剂量范围内。而且随着技术的进步，辐射量也一定会进一步降低。目前来讲，CT检查仍然具有不可替代的作用。
感谢悟空问答邀请，每天都接触这两项检查的医生来回答义不容辞（6）。
有人说神经外科医生就是看片子的医生，看到片子也主要是，CT和磁共振。
那么下面就来说说两着的区别：
除了要看医生的判断检查部位不同，还有哪些对于患者来说更加直观的区别。废话不多说，自己画张表来给你看！
下面就是更加专业一点的内容，也主要是由医生来判断，给你做CT还是磁共振：
CT是根据组织的密度，由于人体不同组织的密度不同，来发现病灶；而磁共振是判断不同加权所产生的不同信号。磁共振于对软组织滑膜、血管、神经、肌肉、肌腱、韧带、和透明软骨的分辨率高。由于其特殊的性质，磁共振看骨头不行，而在大脑的检查中则有着不可替代的作用。
感谢这些检查技术的发展，让每个医生都有了像神医华佗一样的透视眼！也正是因为CT和磁共振让人类医学大踏步的进步。
而且最近由于医保的控制，很多CT和磁共振的价格也相对下调，有的地方甚至减少了1/3。这一点也是造福了许多患者。
磁共振副作用小没错，为什么还要做对人体伤害非常大的CT呢？因为磁共振检查要求比CT严格，不是每个人都适合做，磁共振也不是做每个部位都比CT清楚，虽然磁共振价格贵，辐射小，但是磁共振并不是万能的。
2.肺部和胃肠道的病变不适合磁共振检查
肺部和胃肠道的病变，因为含有空气多，所以磁共振不好观察。如果怀疑肺部病变的，首先选择做胸部CT检查。如果是胃肠道病变的，建议做胃镜或者肠镜检查。但是如果是确诊直肠癌，需要评估分期，要做磁共振检查。
3.有金属内固定的患者，慎做磁共振检查
磁共振检查比CT检查更加严格，要去除身上的体外金属异物，比如钥匙，银行卡等都要取下来。磁共振室是一个巨大的磁场，如果体内装了金属内固定的，一定要告知医生，由医生评估风险后才决定能不能做磁共振检查。特别是有心脏起搏器的患者，更加要慎重。
4.磁共振检查噪声大，空间小
做过磁共振检查的人都知道，做检查过程中不断有各种响声，听着很吵很烦。
磁共振检查室内空间小，有幽闭恐惧症的人要慎做磁共振检查。
5.磁共振价格昂贵
磁共振比CT贵一倍，不适合推广，一般都是做了CT或者超声检查发现病灶后，才做磁共振进一步检查。
头颈部、脊髓神经、肌肉关节、腹部器官(除了胃肠道)都可以很合适做磁共振检查。如果你是经济条件允许，没有以上所说的不适合做磁共振的情况，那么可以选择做磁共振。
CT和磁共振各有优缺点，并不能相互取代，磁共振对于肌肉、软骨、血管等软组织诊断价值高，但对于一些出血类疾病诊断往往没有CT准确，比如急性脑出血，做头颅CT意义要大的多。另一方面，核磁的价格要比CT贵的多，很多排除性诊断，往往会选择CT。所以说，核磁与CT起到互补作用，临床上缺一不可。