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组织学染料、荧光染料和特殊染料用于针对特定细胞和组织结构的染色，也可对微生物染色，帮助识别一抗染色的位置。
查看以下信息，关于
使用特殊染色剂和复染剂的示例。普鲁士蓝铁染色试剂盒染肝组织中的铁（蓝色）。细胞核和背景用核固红复染。
显色复染剂
在用HRP或碱性磷酸酶搭配DAB、AEC或类似的酶底物可视化一抗时，要使用显色复染剂。传统的组合是将苏木精与HRP/DAB合染细胞核。伊红通常与苏木精合用染细胞质。
核固红(Kernechtrot)
荧光复染剂
在使用荧光染料标记的一抗或荧光染料标记的二抗可视化一抗染色时，要使用荧光复染剂。避免使用与可视化一抗所用的荧光染料有发射光谱重叠的复染剂。
DAPI是传统上最常用的荧光核复染剂。
核黄(HoechstS769121)
*酸性条件下发射蓝光/紫光，中性pH条件下发射黄光
特殊染色剂
特殊染色剂用于染特定的细胞类型、微生物以及在组织基质和细胞中的特殊蛋白、碳水化合物和代谢物。
尽管特殊染色方法经摸索建立后使用简便，但其方法建立过程和优化通常很耗时。经实验优化后的特殊染色试剂盒为自己摸索建立染色方法提供了方便的替代方案，而且使用起来通常比传统的染色方法更快。
描述
产品
抗酸菌(AFB)染色剂
染微生物-特别是抗酸细菌和结核杆菌
阿尔丹蓝染色剂
（pH值为1.0）
染黏蛋白-酸性黏液物质被染成蓝色，
细胞核被染成粉红色至红色，细胞质被染成
淡粉红色（用于可视化强硫酸化黏液物质）
（pH值为2.5）
染黏蛋白-酸性黏液物质被染成蓝色，细胞核
被染成粉红色至红色，细胞质被染成淡粉红色
茜素红染色剂
染钙-可能无法特异地染镁、锰、钡、锶或铁
（取决于浓度）
-
淀粉样蛋白染色剂
（刚果红）
染淀粉样沉积物
胶体铁染色剂
染黏蛋白
嗜酸性粒细胞-肥大细胞染色剂组合
染黏蛋白-同时可视化嗜酸性粒细胞
和肥大细胞
铜染色剂
染铜沉积物
弹性组织染色剂
（经Verhoff改良）
染结缔组织（如弹性蛋白）
Fite染色剂
染微生物（如麻风分枝杆菌）
Fontana-Masson染色剂
将黑色素和嗜银颗粒染成黑色
Giemsa染色剂
（May-Grunwald）
用于可视化造血组织中细胞的血液学染色
以及染某些微生物
羟蔗脒
（又名Fluoro-Gold）
荧光标记，用作逆行增强剂标记神经元
（激发波长/发射波长：385/536nm）
改良的Gomori（GMS）
硝酸盐染色剂
染真菌、基底膜和一些机会性感染微生物
（如卡氏肺孢子虫）
高尔基考克斯
（GolgiCox）染色剂
染神经元树突和树突棘
革兰氏染色
染微生物-区分革兰氏阳性菌
和革兰氏阴性菌
幽门螺杆菌快速染色剂
幽门螺杆菌染色
普鲁士（Prussian）
蓝铁染色剂
铁染色-高灵敏度染色剂，将组织中的
铁离子染成亮蓝色
LuxolFastBlue染色剂
将脑和脊髓组织中的有髓鞘轴突染成蓝色，将
神经元染成紫色，将髓鞘和磷脂染成蓝色/绿色
甲基绿派洛宁
（pH值为4.8）染色剂
染DNA、RNA和肥大细胞颗粒
黏蛋白胭脂红染色剂
尼氏（Nissl）染色剂
染神经元胞浆内尼氏体
油红O染色剂
染脂类和脂肪
巴氏(Papanicolaou,PAP)
红染剂
细胞学染色-可区分人体分泌物
（如妇科涂片）中的多种细胞类型
过碘酸希夫（PAS）染色剂
染黏蛋白-将糖原、黏蛋白和真菌染成
洋红且将细胞核染成黑色/蓝色
PieroSirius红染色剂
染结缔组织-特别是胶原蛋白
肺孢子虫染色剂
染卡氏肺孢子虫
磷钨酸苏木精(PhosphotungsticAcidHematoxylin,PTAH)染色剂