鸡蛋壳上可能有枯草杆菌、假芽孢菌、大肠杆菌等细菌，这些细菌在低温下仍可生长繁殖，若是直接放冰箱，会污染冰箱环境，有可能造成交叉污染，影响到其他食物的安全卫生。
而若是将鸡蛋洗一洗，虽然干净了，却会加速其变质。
鸡蛋壳表面其实有许许多多的小孔，而鸡蛋表面有一层肉眼看不到的“保护膜”，将这些小孔“封闭”住了。这层“保护膜”既能防止细菌进入鸡蛋内，又能防止蛋内水分蒸发，保持蛋液的鲜嫩。如果水洗鸡蛋，保护膜被洗掉，细菌和微生物便会轻而易举进入蛋内，加速鸡蛋变质。
正确储存法：
1.买回的鸡蛋装入干净的包装袋中，再放入冰箱蛋架上保存。如果觉得鸡蛋表面太脏，可用干纸巾轻轻擦拭。
2.大头朝上，小头在下。鸡蛋的气室主要集中在大头一端，相比小头向上，大头朝上更能保持鸡蛋的新鲜度。
3.从冰箱中取出的鲜蛋要尽快食用，不可再久置或再次冷藏。因为在进出冰箱的过程中，鸡蛋表面会有一层冷凝的水珠，其中的细菌和微生物可能会很快透过蛋壳深入蛋液内层。
煮鸡蛋、炒鸡蛋、煎荷包蛋等都是常吃的，那究竟哪种更好呢？
在众多的做法里，煮鸡蛋因为烹饪温度低、不放油等特点使营养最大限度地保留，在“维生素保存排行榜”“蛋白质最好消化排行榜”“有益心脏排行榜”等鸡蛋吃法排行榜中均摘得头筹。但是需要注意的是，有些煮鸡蛋也暗藏风险：
1.茶叶蛋
2.溏心蛋
很多人煮鸡蛋或者煎鸡蛋的时候，会特意做成流心蛋或者溏心蛋，但这种吃法其实不推荐。
一般鸡蛋中可能会携带沙门氏菌，如果在烹饪过程中没有充分煮熟，就可能会有残留，吃后可能会引发腹泻、呕吐、发烧等问题。因此，如果实在喜欢吃温泉蛋、溏心蛋等，建议选择可生吃的灭菌蛋。
不过，生鸡蛋营养不如熟蛋，生鸡蛋中有一种抗胰蛋白酶的物质，它会阻碍鸡蛋中蛋白质的吸收；生鸡蛋的蛋清中还有阻碍维生素B7吸收的成分。
正确煮鸡蛋方法：
水烧开后煮三分钟，关火，在锅中焖两分钟。这样煮出来的鸡蛋，灭菌效果最好，也有鲜美的口感。
和其它食物一样，鸡蛋虽好但也不能吃太多。根据2016版《中国居民膳食指南》的建议，在其他食物（奶类、肉类和鱼虾）都正常摄入的情况下，每周吃蛋不要超过7个。也就是说，一般成年人在均衡膳食的情况下，每天可以吃1个全鸡蛋。