1942年清明节，汪精卫在下属的陪同下祭扫中山陵。在扫墓的时候曾对下属说：“如果我死后能葬在中山陵旁的梅花山就好了，这样就可以为先生终日守陵了。”
1944年11月10日，汪精卫因旧伤感染复发，病死在日本名古屋帝国大学医院内。12日，汪精卫的尸体被装在楠木棺材里，由日本军部送回了南京。他的妻子陈璧君和汪伪高层为其墓地选址梅花山顶，遂了他最终的愿望。23日，整个沦陷区放假一天，汪伪高层为其举办了隆重的“安葬大典”，凡愿意参加送葬的市民都可以领取20元中储券（相当于现在2000块钱）。
汪精卫的墓穴建有主墓室、祭堂、警卫室等，完全是仿照中山陵而建造，大约花费5000万伪币。可惜因日本战局节节败退，整个墓穴没能建造完成，但也颇具规模。陈璧君可能感觉到，日军败退后汪精卫的墓穴将不安宁，于是特命人将大约5吨的碎钢铁掺上混泥土，在外面浇灌了一层厚厚的保护壳，这样一般的钢钎就无法打穿墓穴。
1946年1月，日本投降以后“国民政府”打算还都南京，对于汪墓蒋介石认为“有碍国内外视听”，于是秘密命令何应钦为汪墓“挪挪地方”。15日晚，何应钦来到南京，召集了市长马超俊，陆军总部工兵指挥官马崇六，南京宪兵司令张镇，陆军参谋长肖毅肃以及南京警备司令邱维达等高级官员，并由其亲自主持召开了关于汪墓的处置会议。在大会上何应钦说道：“召集各位来，首先对于今天晚上的内容请绝对保密。委员长不久就要回到南京了，汪精卫的墓穴却和国父的陵墓并列在一起，太不成体统了！如果不把它迁掉，全国老百姓会生气，委员长也会生气。怎么个迁法，你们商量个决定把！”
汪精卫
当内穴炸开后，就发现了汪精卫的棺木。揭开棺木，汪精卫的尸体上覆盖着一面青天白日旗，身着国民政府文官礼服，黑色马褂，藏青长袍，头戴礼帽，腰佩大绶。虽死去一年，但整个尸体并没有腐烂，脸部呈褐色。
南京市长马超俊对其尸体进行了全面检查，发现其马褂内兜有一条大约3寸长的白纸，上面由其妻子陈璧君用毛笔写下的“魂来归兮”四个字。还有一本汪精卫的手抄诗稿，最后一首是他临终的时候写下的：
心宇将灭万事休，
天涯无处不怨尤。
纵有先辈尝炎凉，
谅无后人续春秋。
汪精卫墓
汪精卫的棺材搬出陵墓后，官兵当晚将墓穴填平，并将汪精卫的尸体拉到清凉山火化，火化后的骨灰却不知“国民政府”最后如何处置。陵墓的原址看不到一点存在过的痕迹，并在上面盖了一座小亭子，其寓意不言而喻。