临床微生物学是基础和临床间的一门桥梁学科、临床微生物的重要性：微生物无时不有，无处不在(医院)，微生物是许多疾病的直接原因，微生物是大多数疾病发展和转归的参考者，甚至成为致死的主要原因，越是危重病人它越是积极参与
一、临床微生物学的重要
(一)从微生物与常见病、多发病关系
(1)结核
2、从我国居民死亡原因
②脑血管病111.01/10万
②脑血管病112.62/10万
(1)感染是疾病死因的重要原因之一
甲链和金葡菌等可引起急性和亚急性细菌性心内膜炎
(二)从疾病造成的社会危害看
(1)具有传染性，感染率和发病率高;
(2)造成社会问题，如上学、求职、婚姻、子女等很多问题被涉及;
(3)缺乏有效的治疗手段;
(5)花费大量的资金防治。
(三)从我们军医的职责看
战争的危险依然存在，就有生物武器使用的可能。现代分子生物学可以可以制造成更多、更难防的生物武器来。战伤感染的防治、流行病的防治，都是我们的责任。
(四)从具体的医疗实践看
1、无菌观念
2、抗生素的应用—细菌耐药问题非常突出
应进行细菌分离培养、药敏试验，进行选择用药
3、疑难症的诊断—临床明确或排除病原微生物
二、现代临床微生物发展的某些特点
(一)新的病原微生物不断发现
(二)已被控制或趋于消灭的病原、微生物又重新流行
结核：全球有上升趋势，我国下降很慢，主要原因是治疗不彻底，耐药珠增多。国外还有AIDS病发率升高，导致结核感染上升。
(三)细菌感染的变化特点
1、感染类型的改变
2、感染菌的变迁
3、耐药性的变迁
(1)总的趋势是耐药菌株急剧上升，高耐药和多重耐药菌株不断增高。
结论：①大部分菌对不同药物都有较高的耐药比例，有的很高，使用药物频率越高，耐药率也越高。
②大部分菌对多种药物都呈现多耐药。
③只有少数有酶抑制剂的药如泰能、舒普深耐药率较低。
(2)耐药机制
①遗传性耐药机制
A、固有耐药性：由细菌染色体决定的，代代相传的天然耐药性。
抗真菌，对细菌固有耐药à两性霉素B+类固醇;对青霉素G固有耐药àG-菌厚厚的外膜B、获得性耐药：由于细菌DNA的改变，在接触抗菌药物后导致其获得了耐药性。
a、染色体突变：居于次要地位。
b、质粒介导的耐药：在临床上耐药性获得的主要方式。
耐药质粒的传播方式有转化、接合和转导，接合方式最为主要。转座子的参与，扩大了宿主范围，也是造成多耐药株的重要原因。
②耐药性的生化机制
A、产生钝化酶(modifiedenzyme)，又称灭活酶，使抗生素失效
a、β-内酰胺类药物：青霉素酶、头孢菌素酶、广谱BLA和超广谱
BLA(extended-spectrumβ-lactamases,EBLAS)等4类。BLA种类繁多，有染色体介导，有质粒介导，也有两者介导的，是目前G-耐药的主要机制，也是临床上最为重视的酶。
b、氨基糖甙类钝化酶(aminoghycoside-modifiedeczymes)
主要有磷酸转移酶、乙酰转移酶和核苷转移酶等，使氨基糖甙类分子结构发生改变，失去抗菌作用，已有22种之多。一种酶可作用于几种结构相似的药物，一种药物又可被几种钝化酶作用，产生交叉耐药。
c、氯霉素已酰转移酶，可使氯霉素乙酰化而失活。
B、药物作用靶位的改变
青霉素结合蛋白(PBPS)是β-内酰胺类药物结合蛋白，又是细菌维持正常形态、合成细胞壁和分裂繁殖等所必须的酶蛋白。β-内酰胺类药物与PBPS结合后，可使细菌成为球状体、丝状体及分裂障碍，最后死亡。耐药细菌可使PBPS结构改变，与β-内酰胺药亲合力降低，导致耐药。耐甲氧西林的葡萄球菌(methicillin-resistantslaphylococcusaureus,MRSA)除了有正常PBPS外，还有一种PBP2a，由染色体mecA基因编码，具有转肽酶和转糖基酶活性。PBP2a与β-内酰胺类药物亲和力低，在高浓度抗生素存在时，正常PBPS失活，PBP2a就代替正常PBPS的功能，参与细胞壁肽聚糖合成，从而使细菌表现出耐甲氧西林的耐药性。
C、细胞壁通透性的改变和主动排外机制
G-菌细胞壁外膜屏障作用是由一类孔蛋白决定的，若突变造成孔蛋白的丢失或表达降低，影响药物进入而耐药。细菌可主动排出药物，如铜绿假单胞菌就有三种不同的外排系统，nalB、nfxB型和nfxC型，各型耐药谱有一定差异，野生株仅低水平表达nalB型。
D、各类抗菌药物主要耐药机制
(3)目前应重视的耐药检测
①耐甲氧西林的葡萄球菌和耐糖肽类抗生素的多重耐药葡萄球菌
②耐万古霉素的多重耐药的肠球菌
④产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)及AmPC酶的革兰阴性杆菌⑤不发酵糖菌群，如绿脓假单胞菌、不动杆菌的多重耐药问题
(四)医院感染越来越受到重视1、定义
(1)地点：在医院内获得的感染;
2、医院感染的重要性
(1)随医院产生而产生，随医院发展而迅速增长
(2)增加了病人的发病率，死亡率上升，增加了国家和病人的经济负担。
WHO调查，世界医院感染率为3~20%，平均为9%。美国为5%，每年死亡7~8万人，额外支出40亿美元。我国医院感染率为8.4%(1989)和4.6%，估计每年为500万人医院感染，医疗费用增加10亿元。医院感染率作为医院管理水平的重要评价指标。
3、医院感染的分类
(1)按病原体分类
①内源性感染
A、寄居部位改变：正常菌群由于手术或侵入性治疗发生了移位，非致病菌变为感染菌致病。
B、免疫功能下降：容易发生正常菌群或毒力弱的细菌感染，如AIDS患者易感染各种微生物，移植病人易感染病毒、真菌，心脏辨膜畸形者易患亚急性心内膜炎等。
C、菌群失调：免疫抑制剂，激素，抗生素特别是广谱抗生素长期应用，导致菌群失调，还可导致二重感染，如金葡、白念、G-菌、艰难梭菌等。我院2002年临床标本感染率最高的是白念。
②外源性感染
A、病人：最重要的传染源，病人排出的菌毒力高，耐药性强。
B、带菌者：危险性大，因无症状，正常人不会感染，但病人很容易感染。
C、环境感染：医院环境中的微生物。
D、动物感染源：特别是鼠类。
(2)按感染部位分
4、医院感染的微生物
(1)特点
①主要是机会致病菌，主要是内源性正常菌群，少数外源性。
②常为耐药菌或多重耐药菌，住院病人分离菌耐药性高于门诊病人，ICU病房高于其它病房的病人。
③医院感染的病原体随年代不同而变化
目前是G-杆菌，过去有些认为与医学关系不大的变成了流行菌株，如阴沟杆菌、不动杆菌、粘质沙雷菌，肠球菌等。50~60年代为G+球菌，特别是金葡。
④病原体适应性强
(2)医院感染主要病原微生物
主要是细菌，其次是病毒，真菌
5、医院感染的危险因素
(1)易感对象因素
①年龄;
②基础疾病
(2)诊疗技术与侵入性检查及治疗因素
①器官移植;
②血液透析和腹膜透析;
③其它：插管、导尿、器官切开等
(3)免疫系统损害
放疗、化疗、激素应用
(4)其它
抗生素使用不当，手术等。
三、为了准确地检出病原微生物，采集和送检标本应注意以下各点
1、尽量在抗菌药物使用前采集标本。
2、尽可能直接从感染病灶采取标本。
3、采集标本时应严格无菌操作，避免局部正常菌和环境中杂菌的污染。
5、送检标本使用合适的容器，培养基、容器须经无菌处理，但不得使用消毒剂。
6、标本采集后应立即送检，必要时采取床旁接种以提高病原菌的检出率。