招募68名在校非体育专业大学生为研究对象,所有研究对象对实验内容知情同意,均完成了运动风险筛查问卷调查、体力活动问卷、身体活动危险性检查表、膳食调查问卷。实验得到伦理道德委员会批准。
无规律运动,无严重传染病史,无肢体缺陷,无精神疾病,无严重器质性病变,至少一个月内未使用抗生素和抗腹泻药物。
PhusionHigh-FidelityPCRMasterMix,NEB公司;PowerMax试剂盒,MOBIOLaboratories公司;AgencourtAMPureXP60mLKit,BeckmanCoulter公司;AxygenGelExtractionKit(250),Axygen公司;QubitdsDNAHSAssayKit,LifeTechnologies公司;LibraryQuantKitIlluminaGARevisedPrimers-SYBRFastUniversal,KAPA公司;HiSeq3000/4000SBSKit(300cycle),Illumina公司。荧光定量PCR仪,Eppendorf公司;NanoDrop2000C,Thermo公司;PCR仪,BIOER公司;凝胶成像系统,Bio-Rad公司;Qubit2.0,LifeTechnologies公司;核酸分析仪,Agilent公司;高通量测序仪,Illumina公司。
16SrRNA基因作为可以对细菌进行种属鉴定的序列,包括10个保守区域和9个高变区域,高变区域可以体现细菌间的差异。本研究选择V4变异区的正向引物515F(5′-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3′)和反向引物806R(5′-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′)进行PCR扩增。PCR反应体系(50μL):PhusionHigh-FidelityPCRMasterMixwithHFBuffer25μL,515F和806R引物(10μmol/L)各3μL,DNA模板10μL,DMSO3μL,ddH2O6μL。PCR反应条件:98℃30s;98℃15s,58℃15s,72℃15s,25个循环;72℃1min。得到的PCR扩增产物用AgencourtAMPureXP60mLKit纯化,并使用QubitdsDNAHSAssayKit进行量化,最后使用IllluminaHiSeq4000双末端(Pair-End)2×150bp平台进行测序。
根据Barcode序列和引物序列把下机数据拆分为各个样本的数据。截去Barcode和引物序列后,使用VSEARCHV2.4.4对每个样品的Reads进行拼接,得到原始Tags数据(RawTags)。在此基础上对序列质量进行质控、过滤、去除嵌合体序列,得到有效数据,以97%的相似度进行OTU聚类和物种注释。根据聚类结果,使用QIIME和R软件,基于R包“VennDiagram”生成韦恩图,比较不同组之间共有和特有的OTU数目;基于QIIME计算α多样性的值,采用R中的ttest函数和Ape包进行组间香农-威纳指数(Shannon指数)比较并绘制主坐标分析(PrincipalCo-OrdinatesAnalysis,PCoA)图,对运动前后微生物群落结构进行显著性分析;不同分类水平的组间物种构成丰度图使用R包Barplot函数;组间差异物种使用LEfSe默认设置进行各组间分类单位上的检测。
使用SPSS19.0软件对数据进行差异性分析。符合正态分布的数据,描述采用均值±标准差表示,不符合正态分布的数据则采用M(P25,P75)表示;运动前后指标采用秩和检验或配对样本t检验。