当前，复工复产逐步推进、疫情境外输入压力不断增大，以及无症状感染者存在一定传播风险等情况，对新型冠状病毒检测工作提出了新的要求。上海市卫生健康委员会贯彻《关于进一步做好疫情期间新冠病毒检测有关工作的通知》联防联控机制综发〔2020〕152号精神，发布加强本市医疗机构新型冠状病毒检测工作的通知，强调结合国家联防联控机制文件做好贯彻落实。
文件指出，原则上二级以上综合性医疗机构应当建立符合生物安全二级及以上标准的临床检验实验室，具备独立开展新型冠状病毒检测的能力，常态化防控要提升检测能力，大规模开展核酸和抗体检测。这有利于精准防控、维护群众健康、推动全面复工复产；要提升检测技术，抓紧扩大更简便高效准确的检测设备生产和商业化应用，努力做到应检尽检、愿检尽检。这对诸多医院检验科的检验流程、检验质量和生物安全提出了更高的要求。
1.1核酸检测标本
1.1.1采集因素是造成核酸结果假阴性的重要原因，采样人员应经过标准化培训-考核，并有记录。
1.1.2轻症患者、高度疑似患者或有密切接触史者，核酸标本采集优选顺序为鼻咽拭子、口咽拭子、痰液；为提高阳性率，可同时采集1份鼻咽拭子和1份口咽拭子于同一标本采集管中；采样时应选择有国家医疗器械注册证的质量好的无菌植绒拭子，拭子的采集及保存方法应规范；推荐使用带有异硫氰酸胍等病毒灭活剂的采样管，灭活病毒同时提高检出率。
1.1.3为观察治疗期间的病毒清除效果，应收集标本并多次检测。
1.1.4新冠病毒还会影响人体多个主要器官，可对疑似患者的其他部位的体液（如脑脊液、血液等）进行检测。
1.2抗体检测标本
血清、血浆、静脉全血样本都可以进行抗体检测，成人建议采集3~5mL全血以保证能分离获得足量的血清。全血样本可直接使用乙二胺四乙酸（EDTA）抗凝采血管。
2.1核酸检测标本
标本应送至具备检测资质并经省级卫生行政主管部门批准可从事新型冠状病毒核酸检测的PCR实验室。
2.1.4长距离运输若标本需要远距离运输，应当按照《可感染人类的高致病性病原微生物菌（毒）种或样本运输管理规定》[4]（原卫生部令第45号）办理《准运证书》。医疗机构等委托第三方医学检验实验室进行样本检测的，应由委托方负责办理《准运证书》。新型冠状病毒标本运输包装属于A类，对应的联合国编号为UN2814。转运者安全防护按二级防护要求佩戴，并随身携带75%乙醇。司机佩戴外科口罩或N95口罩，通过专用车辆运输。如果经航空运输，包装还应符合国际民航组织文件Doc9284-AN/905《危险品航空安全运输技术细则》的PI602分类包装要求。至少由1名标本运送人员和司机同时转运标本，宜配备标本转运过程监控设施。样本应单独转运，不能和其他物品混杂，禁止气动系统转运样本。
2.1.5样本接收在二级生物安全柜内完成样本接收。实验室接收人员用0.55%及以上含氯消毒液或75%乙醇对转运容器消毒。打开转运容器后立即用0.55%及以上含氯消毒液或75%乙醇喷雾，检查转运盒或者密封袋及样本的密闭性，核对样本信息，包括被检样本姓名、性别、年龄、编号及检测项目等；待检样本的状态如有异常，需注明。
2.1.6样本保存用于核酸检测的样本应尽快进行检测，能在24h内检测的样本可置于4℃保存；24h内无法检测的样本则应置于－70℃或以下保存（如无－70℃保存条件，则于－20℃冰箱暂存）。应设立专库或专柜单独保存样本，避免反复冻融；条件允许时应配备标本保存监控装置。
2.2抗体检测标本
2.2.2样本保存血清及全血样本如果在5d内可完成检测则保存在2~8℃，全血样本不得冻存。血清样本若5d内无法检测则应置于－70℃或以下保存，如无－70℃保存条件，则于－20℃冰箱暂存。标本避免反复冻融。条件允许时应配备标本保存监控装置。
2.2.3运输容器、运输要求、样本接收和样本管理等要求参见“2.1”项下内容。
3.1核酸标本检测
3.1.1检测方法新型冠状病毒常用的核酸检测方法有两种：病毒核酸特异基因检测和病毒基因组测序。荧光聚合酶链式反应（PCR）法是目前临床上广泛应用于新型冠状病毒核酸检测的方法，具有快速、灵敏、特异等特点。由于新型冠状病毒是RNA病毒，试剂盒检测基本都采用反转录加实时聚合酶链式反应法（RT-PCR），扩增病原体的核酸(RNA)，同时通过荧光探针实时检测扩增产物。
荧光PCR基本原理是通过荧光标记的特异性探针，通过对反应过程中PCR产物的标记跟踪，实时监测产物量的增长，根据扩增曲线计算得出起始模板量。新型冠状病毒核酸荧光PCR法检测试剂盒检测靶标主要分为病毒基因组中开放读码框1a/b（ORF1ab）、核壳蛋白（N）和包膜蛋白（E）。推荐选用至少包含针对新型冠状病毒病毒ORF1ab和N基因区域的试剂。
除荧光定量PCR法，目前已获批的新型冠状病毒核酸检测试剂盒还有测序法、恒温扩增法、杂交捕获免疫荧光法和RNA捕获探针法。
基因测序技术在疫情初期甄别病原体中起到了至关重要的作用，也为后续基因扩增检测新型冠状病毒的开展提供了特异性基因组序列信息。但基因测序存在仪器昂贵、操作复杂、耗时长、需要专业人员进行分析等不足，无法在临床上大范围的推广利用，基因测序可用于临床高度疑似、但RT-PCR检测阴性患者的确认，同时也可进一步获得病毒是否发生变异等信息，为后续的疫苗、药物研发等提供数据。
杂交捕获免疫荧光法和RNA捕获探针法，可快速检测病原体核酸，无需核酸提取纯化，无需PCR扩增；通过处理液直接裂解病原体并释放靶核酸，靶核酸和探针形成DNA/RNA杂交体，荧光粒子对DNA/RNA杂交体进行荧光信号识别，实现对样本中目标核酸的定性判断。
3.1.2核酸检测过程质量保证经过卫生健康行政部门检查认证通过，具备生物安全二级实验室、临床基因扩增检测能力，满足国家规定的开展新型冠状病毒核酸检测的能力条件的医疗机构（含医学检验实验室），可开展新型冠状病毒核酸检测服务。
目前使用的核酸检测试剂盒多数尚未进行充分的临床评估，临床实验室应选择国家药品监督管理局批准的试剂开展临床检测，在正式使用试剂前进行性能验证。在实际检测中应严格按照操作规程，注意规范各种细节，避免假阴性及假阳性的产生，保证结果快速、准确。
3.1.2.1性能验证性能验证参数至少包括精密度、符合率和检出限，同时还需要在临床检测过程中累积通过室内质控和临床样本检测得到的数据，以及与其他实验室间的结果对比开展进一步的评价和其他性能指标的验证（如特异性、抗干扰能力等）。通过性能验证形成实验室最优的检测系统，建立具有可操作性的标准操作程序（SOPs）。
试剂和关键耗材（离心管、吸头等）在正式用于常规检测前，应进行耗材质检。使用的关键耗材应不含抑制物，仅使用带滤芯的吸头。试剂及关键耗材更换批号时，实验室应对新批号的试剂和关键耗材进行批间差异的质量检验。不同批号试剂间的差异验证，建议选择阴性（2份）和阳性（3份，其中至少1份是弱阳）的样品，结果符合预期。
3.1.2.2室内质量控制开展新型冠状病毒感染检测的实验室必须建立健全生物安全防范、技术操作规程、质量保证措施及结果报告的规范。每批检测至少有1份弱阳性质控（通常可为检测限的3倍）和3份阴性质控（通常2份为试剂盒自带阴性质控品，1份为生理盐水样本），质控品应随机放在临床标本中间参与从提取到扩增检测的全过程。弱阳性质控测定应为阳性，3份阴性质控应全部为阴性，视为在控。反之，则为失控，不可发出报告，应及时分析原因，必要时重新检测样本。当临床阳性样本不易得到时，可使用质控品稀释。每次检测后，记录弱阳性质控品检测的循环阈值（Ct）值。
对所用仪器（生物安全柜、提取仪和扩增仪等）按要求进行验证和校准，对仪器（如涉及2台或以上仪器）、人员（所有检测人员）、方法（如涉及2种不同试剂/方法）和试剂（不同批号间或运输批号间）进行实验比对。
建议每次实验带入一份生理盐水/焦碳酸二乙酯（DEPC）处理水，开盖放置在提取仪或操作台面上过夜，用于环境污染的评估。建议选择能监控从采样、提取、逆转录到扩增整个实验过程的试剂。如扩增人核糖核酸酶（RNase）P基因作为内部对照，以避免标本因采样问题（如拭子未刮到上皮细胞）或实验操作不当(如保存、运输不当，核酸提取过程中的RNA降解等)引起假阴性结果。建议弱阳性样本应至少用2个厂家的试剂复核检验，以保证结果的准确性。
3.1.2.3室间质量控制每家检测机构保证首次开展新型冠状病毒核酸检测前参加1次室间质评和生物安全督导并合格；以后必须定期（至少每年1次）参加上海市或其他省级以上临床检验中心组织的室间质评和生物安全督导并合格。检测机构室间质评和生物安全督导结果不合格的，不允许开展新型冠状病毒检测。
3.2血清抗体检测
新型冠状病毒肺炎发病3~5d后，血清特异性抗体逐渐产生，首先出现的是免疫球蛋白IgM抗体，然后出现IgG抗体。《新型冠状病毒肺炎诊疗方案（试行第七版）》[6]明确将抗体检测结果纳入确诊病例的诊断标准，以及疑似病例的排除标准。如果疑似病例血清特异性IgM和IgG抗体阳性，IgG抗体由阴性转为阳性或恢复期较急性期有4倍及以上升高，则可以诊断其感染了新型冠状病毒。疑似病例的排除标准，需要同时满足病毒核酸检测结果阴性，以及发病7d后新型冠状病毒IgM和IgG抗体仍为阴性两个条件。
在目前的多项研究中发现，有些患者无法观察到新型冠状病毒IgG抗体出现4倍及以上升高，这可能与检测抗体时已进入了IgG抗体平台期有关，因此，对这些患者建议结合流行病史、临床症状和影像学检查来综合判断。
磁微粒化学发光法检测IgM/IgG和酶联免疫法检测N-蛋白试剂盒也通过审批。酶联免疫吸附法的灵敏度较高，载体标准化难度较低，但检测速度慢、易污染、步骤较为繁琐。磁微粒化学发光法具有操作方便、灵敏性高、特异性强、结果准确性高且稳定、自动化程度高和检测速度快等优点，同时试剂无放射性污染，适合高通量的样本检测，但成本相对较高，依赖于大型仪器设备。
3.2.2抗体检测过程质量保证
3.2.2.1性能验证性能验证参数至少包括精密度、符合率和检出限，同时还需要在临床检测过程中累积通过室内质控和临床样本检测得到的数据，以及与其他实验室间的结果对比开展进一步的评价和其他性能指标的验证（如精密度、符合性等）。通过性能验证形成实验室最优的检测系统，建立具有可操作性的SOPs。
3.2.2.2质量控制建议每批检测设立一个阳性质控、一个阴性质控；阳性质控检测为阳性，阴性质控检测为阴性，视为在控。反之，则为失控，不可发出报告，应分析原因，必要时重新检测样本。对所用仪器进行验证和校准，对仪器（如涉及2台或以上仪器）、人员（所有检测人员）、方法（如涉及2种不同试剂/方法）和试剂（不同批号间或运输批号间）进行实验比对。建议弱阳性样本应至少用2个厂家的试剂复核检验，尽可能使用包被抗原基本一致的试剂盒，若包被抗原不一致，可能检测结果有所不同，例如包被S、N或S+N的不同，检测结果有可能不一致。
IgM/IgG初次检测可能出现的结果有IgM（+）/IgG（-）、IgM（+）/IgG（+）、IgM（-）/IgG（+）和IgM（-）/gG（-）4种模式，可按表1所示流程进行检测以判断患者是否为急性或近期感染。
表1新型冠状病毒核酸与抗体检测结果解读
序号
核酸
IgM
IgG
临床意义
1
+
患者处于感染活跃期，但人体已对新型冠状病毒产生一定免疫能力（持久性抗体IgG已产生）
2
-
患者可能处于新型冠状病毒感染早期，机体免疫应答最早产生抗体IgM，暂未产生IgG或IgG含量未达到诊断试剂的检测下限
3
患者可能处于新型冠状病毒感染中晚期或复发感染
4
患者可能处于新型冠状病毒感染“窗口期”
5
患者近期曾感染新型冠状病毒并处于恢复期，体内病毒被清除，IgM尚未减低至检测下限；或核酸检测结果假阴性，患者处于感染活跃期
6
IgM阳性提示极大可能处于新型冠状病毒感染急性期，此时需考虑核酸检测结果存疑，需要反复取样复查；或由于患者自身类风湿因子阳性等引起的IgM假阳性，需要在1周后复查动态观察
7
+/-
提示患者初次感染载量极低的新型冠状病毒并处于早期，病毒载量低于核酸检测下限，机体产生少量IgM，尚未产生IgG；或由于患者自身类风湿因子阳性等引起的IgM假阳性，需要在1周后复查动态观察。根据IgM和IgG的变化规律诊断
8
9
健康人群或感染潜伏期
核酸阴性结果也不能排除新型冠状病毒感染，需要排除可能产生假阴性的因素，包括：（1）样本质量差，如口咽等部位的呼吸道样本；（2）样本收集的过早或过晚；（3）没有正确的保存、运输和处理样本；（4）技术本身存在的原因，如病毒变异、PCR抑制等。
抗体检测可能会因为标本中存在干扰物质（如类风湿因子、嗜异性抗体、补体、溶菌酶等）、标本溶血、标本被细菌污染、标本凝固不全残留有纤维蛋白原等因素影响而出现“假阳性”结果。同时，由于血清学方法存在一定的窗口期以及检测试剂盒灵敏度不同也会出现“假阴性”结果。因此，抗体检测必须采用IgM和IgG同时检测且通常需多次（2次以上）动态检测确认。
核酸和抗体检测结果不能作为新型冠状病毒肺炎确诊和排除的唯一依据，应结合患者流行病学史、临床症状和其他实验室检查综合判断。
4.1病毒核酸检测
病毒核酸检测应在二级生物安全及以上实验室开展。
4.1.1一般患者（感染新型冠状病毒的概率较低）采集者须二级生物安全防护。
4.2实验室清洁消毒
4.2.1实验室空气消毒实验室每次检测完毕后，应进行紫外消毒至少30min。
4.2.2工作台面、地面消毒每天试验后使用0.55%及以上含有效氯消毒液进行台面、地面消毒。垃圾桶及垃圾袋应喷洒0.55%及以上含有效氯的消毒液。
4.2.3生物安全柜消毒每天试验后用75%乙醇对生物安全柜进行擦拭。配置紫外灯的生物安全柜，每次检测完毕后，应进行紫外消毒至少30min。没有配置紫外灯的生物安全柜，实验结束，风机开启30min后关闭。
4.2.4转运容器消毒转运及存放标本的容器使用前后用0.55%含有效氯消毒液或75%乙醇进行擦拭或喷洒消毒。
4.2.5离心机标本离心无意外，离心停止10min以上，开离心机盖用0.55%含有效氯消毒液或75%乙醇进行擦拭或喷洒消毒。
4.2.6标本销毁完成检测后，标本应在生物安全柜中重新加盖或塞子(新的)，按规定保存。检测结果阴性的标本，保存2周后高压灭菌销毁并做好消毒、销毁记录。标本经高压灭菌处理后应符合生物安全要求，符合感染管理规范。废弃物管理见《新型冠状病毒实验室生物安全指南(第二版)》[8]。
4.2.7检测结果阳性的标本，在完成检测工作后应对剩余标本执行双人、双锁、专柜、超低温暂时保存并配备探头监视；及时通知上级CDC检测部门，联系取样和复检工作。