不同品牌游离核酸保存管的比较

生物通官微陪你抓住生命科技跳动的脉搏

不同品牌游离核酸保存管的比较

编辑推荐:

鉴于游离核酸的重要检测意义,游离核酸的保存条件则直接决定了检测结果的可靠性。为确保游离核酸标本检测的准确性,本文采用了市面上常用的不同品牌游离核酸保存管,就保存效果进行了比较。

1.前言

2材料与方法

2.1材料

2.1.2血液样本健康人血10ml。

2.1.3试剂及设备(1)PremixEXTaq(TaKaRa,Cat.RR390A);(2)探针及引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成;(3)QubitdsDNAHSAssayKit(InvitrogenbyThermoFisherScientific);(4)Beta-actin质粒由上海捷瑞生物工程有限公司合成;(5)BioRad-CFX96(BIO-RAD,Fostercity,California,USA),Qubit2.0Fluorometer(LifeTechnologies,USA),Mili-QAdvantageA10,SHZ-82A恒温振荡器(常州医疗器件厂)。

2.2方法

2.2.1血液样本采集采用标准静脉穿刺采集年龄22-40岁健康人血10ml,各组年龄差异无统计学意义(P<0.05),分别装于采血管及保存管。

2.2.2血浆分离方法轻柔上下颠倒混匀10次,800×g,20min,转移上层血浆至1.5ml离心管;16,000×g,室温,10min,转移上层血浆至1.5ml离心管冻存-80℃备用。提取游离核酸前,室温解冻,16,000×g,5min,吸取上层血浆,进行游离核酸提取。

2.2.3游离核酸提取方法根据QIAampCirculatingNucleicAcidHandbook试剂盒操作说明操作。

2.2.4Qubit荧光计定量血浆游离DNA的浓度采用Qubit2.0荧光计定量血浆游离DNA的浓度。

2.2.5Beta-actin拷贝数的检测Beta-actin10倍梯度稀释107-101,引物分别分actin-F1,actin-R1,探针为probeactin,引物及探针工作浓度为5uM,20ul荧光定量体系引物加入量为各1ul。

扩增程序为50°C、5min,95°C、10min,循环50次,95°C、20s,65°C、20s,72°C、10min,结束。扩增程序试剂组成:

Reagent

体积(ul)

TakaraPremix

10

PrimerF

1

PrimerR

Probe

模板

ddH2O

补足20ul

3结果

3.1不同天数下(25°C)游离核酸保存效果的对比

分别用3种不同的保存管(E、S及B)采集血液10ml,颠倒混匀15次后立即等分4份至无抗凝剂无促凝剂的玻璃采血管中,保存条件为25°C。分别于保存第0、3、7、14天时分离血浆,提取游离核酸。

图1不同保存天数下血液保存现象

图2Qubit检测不同保存天数下每毫升血液cf-DNA浓度(ng/ml)

图3不同保存天数下每毫升血液Beta-actin拷贝数

图3显示:Beta-actin绝对定量结果趋势与Qubit结果基本一致,室温25°C保存3天,3种保存管的差异不显著;保存第7天时,E与B组间的PValue<0.01,差异极显著,B与S组0.01

图4不同保存天数下每毫升血液cf-DNA浓度(ng/ml)

图4Qubit结果显示:三种保存管7天内保存效果无明显差异,14天时,K组与S组保存管均出现明显的上升,分别是第0天的15.27倍和10.21倍,21天时,上升最为明显,分别是第0天的22.46倍和13.84倍。B组保护剂保存的血液在第0、3、7、14、21、28天检测时,每毫升血液cf-DNA浓度均无明显的上升。

图5Beta-actin绝对定量结果与图4基本一致。B2组保护剂保存的血液在第0、3、7、14、21、28天检测时,每毫升血液Beta-actin拷贝数均无明显的上升。

3.2不同天数下(4°C)游离核酸保存效果的对比

图6Qubit结果显示:在4°C情况下,三种保存管0-14天的每毫升血液cf-DNA浓度并无明显的差异。

图7Beta-actin结果显示:在4°C情况下,三种保存管0-14天的每毫升血液Beta-actin拷贝数并无明显的差异。

3.3不同天数下(37°C)游离核酸保存效果的对比

图8不同保存天数下每毫升血液cf-DNA浓度(ng/ml)

图8Qubit结果显示:在37°C情况下,三种保存管0-14天的每毫升血液cf-DNA浓度并无明显的差异。

图9不同保存天数下每毫升血液Beta-actin拷贝数

图9Beta-actin结果显示:在37°C情况下,三种保存管0-14天的每毫升血液Beta-actin拷贝数并无明显的差异。

3.4运输环境(25°C)对游离核酸保存效果的影响

考虑到保存管有可能应用于样品的长途或短途运输,因此需用摇床模拟运输环境对保护剂抑制细胞破裂的影响。S组、K组及B组分别采集血液一份,摇床设置180rpm,25°C,分别在0、3、7、14天检测核酸浓度和beta-actin拷贝量。

图10不同保存天数下每毫升血液cf-DNA浓度(ng/ml)

图10Qubit结果显示:在25°C模拟震荡情况下,三种保存管0-14天的每毫升血液cf-DNA浓度并无明显的差异。

图11不同保存天数下每毫升血液Beta-actin拷贝数

图11Beta-actin结果显示:在25°C模拟震荡情况下,三种保存管0-14天的每毫升血液Beta-actin拷贝数并无明显的差异。

4.讨论

5.参考文献

[1]MANDELP,MéTAISP.Lesacidesnucléiquesduplasmasanguinchezl’homme[J].CRAcadSciParis,1948,142:241-243.[2]LEONSA,SHAPIROB,SKLAROFFDM,etal.FreeDNAintheserumofcancerpatientsandtheeffectoftherapy[J].CancerRes,1977,37(3):646-750.[3]STROUNM,ANKERP,MAURICEP,etal.NeoplasticcharacteristicsoftheDNAfoundintheplasmaofcancerpatients[J].Oncology,1989,46(5):318-322.[4]NortonSE,LechnerJM,WilliamsT,etal.Astabilizingreagentpreventscell-freeDNAcontaminationbycellularDNAinplasmaduringbloodsamplestorageandshippingasdeterminedbydigitalPCR[J].ClinicalBiochemistry,2013,46(15):1561-5.[5]RyanWL,FernandoRM,DasK.BLOODCOLLECTIONDEVICEFORSTABILIZINGCELL-FREEPLASMADNA:,WO2013123030A3[P].2013.

THE END
1.核酸标本采集后保存温度核酸标本采集后保存温度 1.标本采集后能在24小时内检测的标本可置于4℃保存;24小时内无法检测的标本则应置于-70℃或以下保存(如无-70℃保存条件,则于-20℃冰箱暂存)。 2.标本采集后室温放置不超过4小时,应在2~4小时内送到实验室。http://beijing0763152.11467.com/news/2100641.asp
2.核酸标本采集后保存温度采集后24小时内可检测到的标本,可在4℃保存;24小时内不能检出的标本应保存在-70℃或以下(如无-70℃保存条件,应保存在-20℃冰箱中。...2.标本采集后在室温下保存不超过4小时,并应在2~4小时内送至实验室。https://m.antpedia.com/news/2865317.html
3.新型冠状病毒感染肺炎实验室生物安全与检测技术指南问与答问题51:2019-nCoV标本保存需要专门的冰箱? 解答:需要,设立进行2019-nCOV标本的独立的冰箱,双人双锁,检测完毕非上交CDC标本就地高压销毁。不得用于其它用途。 问题52:提取核酸等相关耗材需要评估? 解答:需要,尤其对耗材是否含有RNA酶进行评估。 问题53:56℃、30min灭活2019-nCoV标本会影响检测结果? https://www.ivdchina.org/cclabd/show-1052.html
4.凝血检测标本的采集运送处理和保存DNA可从多种标本中获得,包括全血、干血、口腔、唾液和血浆。DNA标本的质量和分子重量各不相同,取决于标本采集、处理、操作和保存技术。以下关于标本采集的建议只是一般的指南,实验室应该根据厂商的说明采集与试剂盒匹配的标本。 (1)抗凝剂 血标本:抗凝剂的选择应该根据核酸的来源、检测的项目以及所需的标本体积。有...http://www.bitebo.com/a/gb2312/news/20110423/4427.html
5.医学实验中心甲流监测工作制度医学实验中心实验室检测人员收到标本后24h内进行标本处理或核酸检测。 (1)标本处理:用涡旋震荡仪充分震荡样本采集管,使病毒从棉签上释放到采集液中。将标本分为3份,1份用于核酸检测,1份用于MDCK细胞病毒分离,余下的标本分装到两个冻存管中,用于样本保存。用于核酸检测和病毒分离的样本如果在48h内检测,则放置于4℃,以避免反...https://www.ahswmu.cn/site/yxsyzx/detail/993ddd60-fe1b-44ae-cced-1875a018.html
1....能在24小时内检测的标本可置于多少度的冰箱保存刷刷题APP(shuashuati.com)是专业的大学生刷题搜题拍题答疑工具,刷刷题提供用于病毒核酸检测的标本应尽快送检,能在24小时内检测的标本可置于多少度的冰箱保存,24小时无法检测的标本则应置于多少度的冰箱保存()A.4℃,-70℃B.6℃,-70℃C.4℃,-50℃D.6℃,-50℃的答案https://www.shuashuati.com/ti/90dc338955504fbd881122b822c1bb59.html?fm=bd73bdf52fc4dae1c26519c4cdecf0d2fd
2.4度标本冰箱(隔离点临时保存核酸标本)价格厂家欢迎前来供应商网(https://www.gys.cn)了解北京福意电器有限公司发布的4度标本冰箱(隔离点临时保存核酸标本)价格、厂家信息,产品和服务质量好,性价比高,为您节省采购成本!进网站查看卖家电话。https://www.china.cn/hengwenshiyansheb/5028430210.html
3.求助标本保存核酸基因技术大家好!我想问问动物标本保存的具体方法。我想做一个PCR实验。 dhanks 神经科医师 标本用铝铂纸包裹,-70度可长期保存。 2006-08-07· IP广东 回复 likearock 在液氮中冻多久再放到-70℃?从液氮放到-70℃,温度的升高不会导致RNA降解吗? rainlhy https://3g.dxy.cn/bbs/topic/6769531
4.核酸检测防控制度为进一步做好新冠肺炎疫情常态化防控工作,巩固当前防控成果,指导各区市、相关医疗机构规范新冠肺炎核酸检测采样点(以下简称采样点)相关工作,完善标本采集和送检流程,加强生物安全防护,根据《新型冠状病毒实验室生物安全指南(第二版)》《山东省新型冠状病毒感染肺炎实验室检测技术方案》(鲁卫函〔20xx〕63号)、《关于进一步...https://www.yjbys.com/zhidu/2897104.html
5.核酸标本安全管理包括.pptx核酸标本安全管理Contents目录核酸标本的采集与运输核酸标本的保存与处理核酸标本的质量控制与检测核酸标本的安全管理与法规要求核酸标本的采集与运输01 采集过程中的安全措施采集人员防护采集人员应穿戴符合要求的个人防护装备,如医用外科口罩、一次性手套、隔离衣等,以降低交叉感染风险。采集环境控制采集环境应保持清洁、卫生...https://m.renrendoc.com/paper/307936166.html
6.体液检验知识必知事项2.标本应在室温条件下尽快送检;细胞计数和分类计数的标本应尽快检测,若无法及时检测,染色后的标本置于2 ℃~8 ℃条件下保存,宜 48 h 内完成检测。 二、化学和免疫学检查 1.浆膜腔积液化学检查主要包括蛋白质、乳酸、葡萄糖和酶学测定等;免疫学检查主要包括肿瘤标志物、免疫球蛋白测定等。 https://www.hbccl.cn/content/898
7.核酸标本泄露的应急预案范文(精选9篇)在我们平凡的日常里,保不齐会遇到一些意料之外的事件或事故,为了将危害降到最低,可能需要提前进行应急预案编制工作。那么问题来了,应急预案应该怎么写?下面是小编为大家收集的核酸标本泄露的应急预案范文(精选9篇),供大家参考借鉴,希望可以帮助到有需要的朋友。 https://www.ruiwen.com/yingjiyuan/6049527.html