其中90%的感染由猫疱疹病毒(FHV)（又名猫鼻气管炎病毒）和猫杯状病毒(FCV)引起。
支气管败血性博代氏杆菌和猫衣原体（先前又称鹦鹉热衣原体感染）次之。
其他病毒和支原体可能作为原发性或继发性病因出现，而细菌感染通常为继发性。
从无症状的猫中可以分离到博代氏杆菌，但其传染性尚不清楚。
临床表现
该病的病程有急性、慢性间歇性和慢性持续性3种表现。
最常见急性，表现为发热、打喷嚏、浆液性或黏液脓性鼻分泌物、结膜炎和眼分泌物增多、唾液分泌增多、厌食和脱水。猫疱疹病毒还会导致角膜溃疡、流产和新生儿死亡；猫杯状病毒则引起口腔溃疡、轻微的间质性肺炎或多关节炎。曾出现过杯状病毒强毒株短期暴发（罕见），患病动物伴有严重的上呼吸道疾病，其症状包括全身性血管炎（面部和肢体水肿，进而发展为局部坏死）和高死亡率。博代氏杆菌主要引起咳嗽和幼猫肺炎。而衣原体感染通常并发结膜炎。
一些猫急性发病恢复后很可能会周期性复发，通常与应激或免疫抑制有关。另一些猫可能会转为慢性持续性症状，最明显的就是浆液性至黏液脓性鼻部分泌物，可能会伴有喷嚏。
慢性鼻部分泌物可能与持续活动性病毒感染或疤疹病毒对鼻甲和黏膜造成的不可逆性损伤有关。而后者会使得患猫对刺激物更加敏感，从而继发细菌性鼻炎。
诊断
急性上呼吸道感染通常可以根据病史和体格检查做出诊断。
猫疱疹病毒、猫杯状病毒、博代氏杆菌和衣原体的特异性检查方法包括聚合酶链式反应(PCR)病毒分离或细菌培养以及血清抗体滴度检查。
可以用灭菌棉拭子采集咽、鼻或者结膜处的样本，或采集组织样本（例如扁桃体活检取样，或黏膜刮取样本）进行PCR检测和病毒分离试验，通常首选后者。取得的样本置于病毒转移培养基中。
常规结膜涂片细胞学检查可观察到胞浆内包涵体，提示衣原体感染，但这些发现并无特异性。
常规的口咽部细菌培养即可观察到博代氏杆菌，但健康猫和感染猫中均有可能存在这种细菌。如果2~3周内抗体效价呈持续上升，这一趋势则可证明为该病毒感染。
不论使用何种技术，为了获得理想的结果，建议病理实验室在样本采集和处理中进行严密协作。
当本病在猫舍中暴发时，对特殊病原体的检查就显得特别重要，因为此时兽医师还应提供针对性的预防措施。无论是否表现症状，当需要进行猫舍调研时，都应对每一只猫进行病原体检测。可以使用针对多种呼吸道病原体的商业PCR试剂盒。对每只猫逐一进行特殊检查的意义不大，因为最终的结果不会改变治疗方案。
如果是鼻损伤所造成的持续性鼻分泌物，或者取得的样本中恰好没有病原体存在，就会得到假阴性结果。阳性结果可能只是反映了一只猫受感染的情况。还可能有例外情况，譬如衣原体感染等，此时就应该给予相应的特异性治疗。
治疗
对于多数猫来说，上呼吸道感染是一种自愈性疾病，对急性症状患猫，主要是采取合理的支持疗法。
猫上呼吸道感染疾病管理思路图
应满足其对水和营养的需求。将脸上或鼻孔周围的黏液和渗出物清理干净。可以把猫放在充满蒸汽的浴室或者设有蒸发器的小房间里，每天2-3次，每次15-20min，这对分泌物的清除很有帮助。
可用一些儿科局部缓解充血的药物对严重的鼻充血进行治疗，如0.25%去氧肾上腺素或0.025%羟甲唑啉。每天滴鼻1次，每侧鼻孔各1滴，连用3天。如果有必要，可间隔3d再用1次，以防止停药后反弹。另一种推荐的方法是隔日用1次药。
如果患猫的临床症状十分严重，则需采取抗生素控制继发性细菌感染。
最初可选用氨苄西林(22mmg/kgq8h)或阿莫西林(22mg/kgq8~12)因为它们通常比较有效，而且副作用少，可用于幼猫的治疗。
如果不疑有博代氏杆菌、衣原体或支原体感染，可以使用多西环素（5~10mg/kgq12h，口服或随大量水服用）。使用多西环素治疗猫衣原体或支原体感染，需要持续合药42天至病原消失。病情顽固的猫也可使用阿奇霉素(5~10mg/kgg24h连用31天，然后每48h用药1次，口服)。
赖氨酸对疱疹病毒患猫的治疗可能有一定帮助。有假设认为，高浓度赖氨酸能够拮抗精氨酸，而后者是疱疹病毒复制药启动子。可以购买宠物用赖氨酸（每只猫200mg，q12h），并添入患病动物的食物中。
给予猫重组ω干扰素或人重组α-2b干扰素可能对疱疹病毒患猫有一定帮助。
如果动物生活在衣原体多发地区或有结膜炎表观，则应考虑衣原体感染的可能性。此时，应至少口服生素42天。另外，每天涂抹氯霉素或四环素眼膏，至少每天3次，在症状消失后至少再用14天。
在急性上呼吸道感染或由疱疹病毒引起眼部病变时，禁止局部或全身使用皮质类固醇。它们会使病程延长并增加病毒排泄。
对独养猫的预防
本病的预防措施主要是将动物与传染源（如FHV、FCV、博代氏杆菌和衣原体等）隔离，增强自身免疫力。
大多数家猫对上呼吸道感染所致的慢性疾病具有一定的抵抗力，一般来说健康猫皮下注射疫苗就可以产生有效的保护。疫苗可以极大地减轻上呼吸道感染导致的一系列症状，但并不能预防感染的发生。应建议动物主人严格限制猫的户外活动。
目前最常用的是猫三联弱毒疫苗，它为猫提供针对FHV、FCV和猫瘟病毒的保护。疫苗使用方便，且合理使用此疫苗并不会引起临床症状，在不与强毒密切接触的情况下，可以为猫提供充分的保护。
疫苗对于尚有母源免疫的幼猫不具有保护作用。
通常幼猫首次免疫在6~10周龄时进行，3~4周后再注射1次。也就是说首免必须注射2次并且确保幼猫在已满16周龄时进行第二次注射，1年后加强免疫1次。此后推荐每3年对其进行1次加强免疫，除非动物暴露在高感染风险的环境下，则需要改变免疫计划。
通过检测猫血清中FHV和FCV抗体水平可了解动物的抵抗能力以及是否需要再次接种疫苗。
母猫在繁育之前应进行免疫。
皮下注射弱毒FHV和FCV疫苗很安全，但如果猫通过常规口鼻感染途径接触到该疫苗则可能会导致发病。应避免猫接触到雾化的疫苗，如果注射时不慎将疫苗漏在动物身上，应立即将其洗净，以防猫在舔舐过程中接触到病毒。
弱毒疫苗不宜用于妊娠母猫。
针对FHV和FCV的灭活苗可以用于妊娠母猫，灭活苗还可以用于感染猫白血病病毒(FeLV)和猫免疫缺陷病毒(FIV)的猫。
弱毒FHV和FCV疫苗同样可经鼻腔内给药。给药后有时会出现急性上呼吸道感染的症状。需要留意这些经鼻腔给药的疫苗是否包含猫瘟疫苗，是否需要另外经皮下注射猫瘟疫苗。
针对博代氏杆菌和衣原体的疫苗仅推荐猫舍或疾病流行区域使用。其感染并没有FHV和FCV那么普遍，且博代氏杆菌感染主要发生于群居猫舍。另外，这些疾病可通过抗生素疗法进行有效的治疗。
预后
急性上呼吸道感染患猫预后良好。大多数宠物猫很少发展为慢性疾病。