医院如何做好生物样本库的信息化建设干货

随着现代生物技术的快速发展,生物样本库建设已势在必行。生物样本库又称生物银行(Biobank),20世纪80年代初期以美国为首的一些发达国家开始建立具有完备生物信息的网络化生物样本库,这一举措使得生物样本库建设更为规范化、标准化、专业化、职能化、产业化和信息化。生物样本库信息管理系统主要是将患者的基本信息、随访信息、病理信息、治疗信息和患者样品存储信息等联系在一起的网络化集成信息平台,可为临床疾病的发生、诊断、转移机制研究、治疗、预后、疾病流行特征及动态分析等临床医学研究提供必要的决策和支持。建立一套信息全面而专业化的特色生物标本库管理系统,对患者各类标本信息进行完善的管理,是进行医学研究的重要方法和手段。

目前,国内外生物样本库的信息化建设各具特色。唐颐团队与国内各类型医院、高校及科研机构深度合作,包括大型三甲医院301医院、上海市东方医院,及知名专科型医院如上海东方肝胆外科医院,政府职能部门如上海市疾病控制与预防中心等,结合其生物样本库建设现状,依托唐颐公司多年积淀的生物医学信息学技术,成功开发了一套成熟可行、可供参考和推广的标准化生物样本库信息理系统,为样本库信息管理工作更加规范化、智能化提供了可靠保障。

医院生物样本库信息化建设范围

为保证快速、准确地存取样本,唐颐样本库团队结合医院实际需求,研发了同时适用于预制二维码和贴码管两套业务流程的信息系统。该系统设置两套操作界面,可以满足生物样本库工作人员和临床研究人员同时査看库内样本与数据情况的需求。

图一唐颐临床数据与样本资源库信息管理系统

针对目前全国医院病历数据、生物样本缺乏共享而造成的巨大资源浪费等严重问题,期望通过该项研究,探索出科学、高效的共享机制,建立一套成熟、可行、可供参考和推广的信息管理与运行模式。

与此同时,唐颐样本库信息管理系统增加了温控报警、软件模块,如遇低温冰箱损坏或断电等意外情况造成冰箱及各储存房间温湿度浮动较大时,系统将自动发送提醒短信至工作人员,保障了生物样本库运营环境的安全可靠。

2.2生物样本库信息系统基础设备

基础设备主要包括:

服务器、电脑终端、扫码枪、条码打印机、二维低温条码标签、色带、温控模块、测温探头、样本库管理系统、随访系统、温度控制报警系统和Windows操作系统等。

2.3建设步骤

样本库的信息化建设为临床与转化医学的研究搭建了网络支撑平台。

在建设过程中,院领导定期组织召开样本存取流程规范、随访与结构化病例获取等专题研讨会,各临床科室负责人,样本库人员,科研处、信息科工程师和唐颐公司项目负责人均参加会议。

各科室负责人和样本库人员科室负责人员提出个性化需求,信息科工程师和公司项目负责人依据各科室需求制定个性化软件模块,在科研处、医务处和信息科的协调管理和支持下,使得各临床科室的需求不断细化完善并最终得到满足,实现了“提需求——共研讨——软件模块不断完善”的良性循环模式。

2.4应用情况

2.4.1样本库管理系统

图二系统功能架构

目前,应用唐颐样本库信息管理系统的医院或机构,已超过50家单位,包括综合性多科室样本库,专科型多中心样本库,基于行政管理需求的疾控样本库等。

参照国际标准和我国现有行业标准,可与医院信息系统等无缝链接,建立统一的临床标本收集和管理规范,提供基于互联网的多种疾病、多个单位样本收集的信息平台,保障组织标本的标准化、专业化管理和应用共享。

(1)样本管理流程

样本库使用前,需要管理员预先设置好患者信息格式、样本条码规则、冰箱规格、操作者字典、样本类型、疾病或专科类型等信息。

入库样本:在样本分装完毕之后,依据取材知情同意书创建样品信息,随后将样本信息入库(或后期补录),打印二维条码,将二维条码贴于用于存放样本的冻存管或EP管侧壁,最后将样本实体依据入库信息顺次迅速入库。

编辑入库样本:样本入库后可通过样本库管理系统操作界面进行编辑,已建立病案的患者因病案号独立唯一不能修改,且系统将自动记忆存储编辑过程的痕迹。

核查样本入库位置信息:每月月底样本库工作人员将对新入库样品进行抽查,便携式移动扫码枪抽检扫描部分样品,与入库样本信息进行仔细核查,确保工作准确高效。

(2)临床科研工作流程

临床科研工作者,登入样本库系统,根据自己的科研实际需求,进行病例或样本的筛选。如须入组研究的样本为:男性、年龄在50岁~70岁的肝癌患者,唐颐样本库信息系统具备强壮的组合查询功能,将筛选条件快速灵活组合,并检索到目标病例以及病例对应样本,同时支持样本对应临床资料和随访资料批量导出,以便于科研人员利用第三方工具对数据进行深入的分析挖掘。

2.4.2温度控制报警模块

依据样本库运营环境的特殊要求,采用人工设定温度变化限度——定时采集各冰箱温度——无线发送预警信息模式,系统自动不间断记录温度变化点,同时绘制温度变化曲线,方便工作人员调看温度在一定时期的波动变化。系统通过模块发射无线信号,再将信号转变为电信号返回至计算机主页,工作人员可远距监测样本库各冰箱及储存室温度、湿度,大大提高了工作效率,保障样本库的顺利运营。

2.4.3随访系统

2.4.4基于生物样本库的医学大数据平台

(1)临床路径管理研究平台。建设基于循证医学证据的医学流程病种库,内置于临床路径信息系统中,在临床上实现规模化应用。可以实现临床路径与医嘱整合,变异原因全过程追踪,新路径智能化辅助生成以及路径监督、评价、改进、分析4大核心功能,从而实现规范化的诊疗。

(2)临床组织标本库。在医院实现重点临床组织标本的标准化采集和管理,构建基于RFID技术的信息系统,保障组织标本的标准化、专业化管理和应用共享。

2.5效果

3结语

在国际生物样本库网络化大趋势、临床医学研究平台建设兴起与创新的形势下,生物样本库化、智能化和规范化的管理模式将更加有益于信息化建设,一个智能网络化的生物样本库运营管理时代已经到来。

THE END
1.生物样本分析员岗位职责生物样本分析员工作内容2.负责建立实验室生物安全管理制度并执行,确保生物安全意识得到保障 3.负责对生物样本进行高通量测序及数据分析工作,根据质控要求完成数据记录和报告编写等相关工作 4.配合上级主管完成其他临时性工作任务 5.严格遵守相关规章制度,保护实验人员和设备的安全与尊严 ...https://www.liepin.com/gw/swybfxym64u/
2.《转》访:王伟业教授生物样本库的建设关键在于信息化架构和管理...引言:随着"十二五"国家科技计划的推进,我国的生物样本库建设蓬勃发展。上海交通大学医学院附属新华医院王伟业教授作为国外引进的样本库信息化管理专家,主要从事生物样本库建设和信息化管理方面的工作,指导多家医院生物样本库基本的建设工作。近日,转化医学网走进新华医院,对王教授进行了专访。 https://www.360zhyx.com/home-research-index-rid-30084.shtml
3.生物样本库工作人员,深圳市儿童医院最新招聘信息,深圳医院招聘,深圳护士...点击查看深圳市儿童医院在康强医疗人才网上发布的最新招聘信息。深圳市儿童医院面向医护人才招聘生物样本库工作人员等诸多职位https://www.kq36.com/25/191011
1.武汉生物样本库有限公司怎么样武汉生物样本库有限公司招聘要求怎么样:武汉生物样本库有限公司都在招什么人? 招聘类别生物/制药/化工/环保类最多占50%,其次是经营管理类占50%。什么学历能进?博士最多占100%,学历要求高吗?博士占100%,工作经验有什么要求?不限经验最多占100%,工作地区在哪?武汉最多占100%, ...https://www.jobui.com/company/16256555/
2.生物样本库工作人员招聘公告人才招聘现因医院发展需要,根据《上海市事业单位公开招聘人员办法》(沪人社规〔2019〕15号),按照公开、平等、竞争、择优的原则,面向社会招聘公开招聘工作人员: 一、招聘岗位 (一)生物样本库工作人员1人 二、岗位职责及任职条件 (一)岗位职责 1)从事生物样本库的日常工作内容,包括但不限于生物样本的接收、处理、出库、保存...https://www.xinhuamed.com.cn/zhaopin/job-5253.html
3.四川大学华西医院生物样本库招聘启事四川大学华西医院与医院签订劳动合同 岗位职责 1.完成生物样本库日常管理工作; 2.协助相关负责人做好生物样本库部分建设性工作; 3.熟悉生物样本的质量控制和科学研发工作、清楚涉及人的生物医学伦理知识、了解临床研究项目申报; 4.协助组织生物样本库人员进行培训; 5.协助完成国家、省市级项目; ...https://www.wchscu.cn/public/notice/recruit/64240.html
4.关于招聘生物样本库工作人员的通知因工作需要,拟招聘东南大学附属中大医院生物样本库工作人员2-3名。具体要求如下: 1、岗位数量:2-3人 2、学历及专业要求: 本科及以上学历,病理学、病理生理学、生物信息学、医学检验学等相关专业。具有研究生学历者优先考虑。 3、年龄在30周岁以内(1986年1月1日以后出生),身体健康。 https://www.njzdyy.com/info/1029/3507.htm
5.个人简历标准样本国内在生物样本库的建设上已经积累了一定经验, 但生物样本库行业的统一标准, 尚需针对业内大量实践工作进行系统总结。目前, 上海医药临床研究中心已编制“生物样本库建设最佳实践规范”, 并获得著作权, 该材料已被“十二五”国家重大新药创制科技重大专项临床标本资源库使用, 作为学习材料在全国200家医院进行使用推广[2...https://www.360wenmi.com/f/filezw1i9pll.html
6.中国研究型医院生物样本库建设与管理安全规范《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》[3]、《病原微生物实验室生物安全管理条例》[4]等相关管理规定和技术标准要求,参照国际最佳实践及规范[5,6],结合实际工作经验,中国研究型医院学会临床数据与样本资源库专业委员会经过多轮讨论,从生物样本和生物样本库安全的双重视角出发,对当前生物样本库建设与管理中的安全规范...https://rs.yiigle.com/cmaid/1446382
7.国家干细胞转化资源库2022年7月,上海市东方医院生物样本库在前期工作基础上,开展第二轮人类遗传资源保藏行政许可申请审批工作。这是继2017年7月首次申请获批后(国科遗办审字﹝2017﹞1540号),再次向科技部申请提交保藏资质审批。 近年来,随着《中华人民共和国生物安全法》《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》等法律法规出台,明确规定开展...https://nsctrc.tongji.edu.cn/article/hardNews/20220817/2ae4b6e9c3d041eb98641b3bb00da886.html
8.样本存储武汉大学中南医院生物样本库开展人类遗传资源收集工作之前,武汉大学中南医院各科室及院外单位或个人向生物样本库提出人类遗传资源入库申请,填写《人类遗传资源入库申请表》,签署《湖北省人类遗传资源保藏中心保藏协议书》,若入库类型为项目依托,则另外应准备项目知情同意书、伦理批件及研究方案复印件,将上述材料准备完整后提交给生物样本库。 http://biobank.znhospital.cn/?ybcc/
9.建院75周年丨吉大一院临床研究部生物样本库举办“人类遗传资源...2024年7月25日至28日,由中国人体健康科技促进会主办、吉林大学第一医院(以下简称:吉大一院)生物样本库承办的“人类遗传资源保藏”岗位技能培训班和“生物样本库内审员”集训班在吉大一院顺利举办。北京协和医院临床生物样本中心主任郭丹、首都医科大学附属北京友谊医院生物样本库副主任张允、解放军总医院生物样本中心主任王...https://www.jdyy.cn/index.php?m=home&c=View&a=index&aid=74350
10.喜讯!我院生物样本库获批国家科技部人类遗传资源保藏行政许可我院生物样本库依据《中华人民共和国人类遗传资源管理条例》(国令第717号)规定,经提交材料审核、视频答辩和人类遗传管理办公室汇总评审,于2021年5月7日正式通过国家科技部中国人类遗传资源保藏行政许可审批(国科遗办审字[2021]BC0005号),标志着我院生物样本库保藏工作得到了国家层面的认可,我院也成为自《中华人民共...https://www.hbydsy.com/info/1012/4003.htm
11.众志成城战洪水我院生物样本库7?20抗洪纪实无论如何都要保护好生物样本库内的设备、资料、药品和生物样本,这是医院党委委员、医院副院长 在李素云和王海峰带领下,样本库的同志们迅速投入防汛抢险工作。面对如此大的洪水,医院备用的沙袋已经捉襟见肘,更无可用人员帮助搬运。水位不等人,我们自己搬!领导和同志们叫上保洁师傅毫不犹豫的拎起沙袋,在电梯不能用的...https://www.hnzhy.com/NewsDetail-12166.html
12.干细胞技术破解卵巢早衰难题,降宝宝在南京鼓楼医院诞生!南京鼓楼医院生物样本库遵照国际和国家样本库标准,建立全流程样本库质量管理体系。依据样本库工作流程,建立样本库四级质量管理体系文件,包括质量手册(1个),程序性文件(18个),标准操作规范(SOP)(75个)和记录表单(64个),共计158个,涵盖人员、场地、物料、方法、环境五个方面。根据每个样本采集保存项目,与样本采集保存...https://www.hicells.cn/linchuangyanjiu/176.html