飞控系统FC一1战斗机采用了一套独特的飞行控制系统。这套精心设计的系统具有高性能、低价格的特点，既能利用电传控制系统的先进飞行控制能力，放宽飞机静安定度、提高机动性能，又保留了传统部分液压管路和系统作为次要部件的操纵和安全备份，完全满足了FC一1这种定位独特的战斗机高性能方面的需求。
FC一1采用了一套经过精简的混合式电传操纵系统。为了实现高升力、高敏捷性，飞机在纵向采用了数字式全权限四余度加两余度模拟式电传操纵系统，控制机动性能最关键的襟翼、全动平尾；横向则采用数字式两余度有限权限控制增稳，以机械式操纵系统为备份，控制方向舵和副翼。FC一1的气动控制面设计构思相当精巧，没有采用三代机流行的襟副翼设计，而是将它们分开，由此副翼的功能被独立和简化了。对于大量应用放宽静稳定度而采用全电传系统的第三代战斗机而言，其所谓的放宽静稳定度主要还是指纵向静安定度，所有战斗机的横向都是静安定的。所以，完全的三轴四余度电传操纵系统中，横航向的部分并不能从电传系统中获得多大好处，相反还要付出3个以上控制面的通道和35%以上的软件工作量。
FC一1战斗机因为定位于低价、高性能，为了高性能必须采用放宽静稳定度的布局，这就需要一套全权限电传操纵系统，其价格往往超过数百万美金。中国有句谚语：好钢要用在刀刃上。FC—l战斗机的总设计师深知操纵系统特点，所以大胆地把最需要电传系统的纵向操纵面和只需要控制增稳就能满足要求的横向操纵面独立开来，然后各自采用一路完全不同的控制系统。其实FC一1的横向操纵面也可以看作是在一个2余度电传系统控制下操纵的。正常情况下，飞机采集飞行控制杆指令和惯导系统的姿态参数、大气计算机的空气参数等，在飞行控制计算机内进行数字综合，通过三轴控制率驱动纵向动作伺服器和横向电动舵机，实现三轴控制增稳。横航向的机械控制系统通过传统拉杆和摇臂，实现对副翼和方向舵的控制；控制增稳电传操纵则通过和机械系统耦合的复合摇臂实现，控制增稳的操纵通过计算机控制的电动舵机加入到控制通道中去。前缘机动襟翼是自由的，在电脑控制下自动对应速度和迎角对称偏转，仅在失速时可以手动强制恢复。
FC一1的操纵系统的可靠性非常高，四余度电传系统本来就具有两路故障安全的能力，如果四路都出现问题，还可以降级到模拟电传控制。这套系统能满足飞机返航、降落以及大部分普通飞行操作的实施；横向控制增稳也是一样的，本身具有两路故障安全的结构，加上机械系统也是双余度的，控制增稳发生故障时也可以降级使用，同样可以满足正常的飞行和返航降落。FC一1复杂的可靠性设计在日常使用中不大可能有用武之地的，但还是大量考虑了作战条件下飞机的容伤特性，因此才设计了如此复杂和坚固可靠的系统。
由于FC一1实际上是具有飞控计算机控制下的全自动控制飞行，因此配合雷达地形跟踪能力和惯性导航系统的地理信息系统，具有超低空自动地形跟踪飞行能力。以往的超低空飞行都是依靠飞行员技术好、胆子大，一旦遇到复杂地形条件和要求进入更低的高度，就是人力不可完成的了。FC一1可以由飞控软件形成自动驾驶仪，自动完成在超低空条件下的安全飞行，为其对地攻击能力的拓展打下了良好的基础。
从试飞员的实际体验来看，这套简化组合的飞行操纵控制系统获得了极大的成功，飞行员都赞赏其机动控制能力、平稳的飞行能力和良好的操纵感。FC一1的操纵杆不象F一16那样采用力耦合，而是采用位移和力回馈双重耦合，电传系统和机械系统间的操纵感觉几乎完全一致，力回馈的感觉更直接，操纵感觉更接近传统的战斗机，但有更加轻巧和简单。
FC一1的飞行控制系统是一个工程学上的杰作，完美体现了性能和价格有机结合的过程，实现了既高性能又廉价的既定设计目标。
从性能上来说，这套系统和F一16的三轴四余度电传系统效能毫无二致，而从价格来说，这套系统仅为F一16系统的一半，真是一个了不起的创举，世界范围内还没有看到如此精心设计和选取的设计方案。
先进电子识别系统早在60年代的越南战争中，美国就认识到超视距空战取决于敌我识别方面的水平。但早期的电子技术不足以解决这个问题，应答式敌我识别器只能辨认不到30%的目标，再加上早期电子设备可靠性低，“麻雀”导弹刚开始应用时击落己方飞机比击落敌机数量还多。此后美国空军颁布一条交战法则：即所有空中目标不经过确实可靠的辨认和识别，不允许发动攻击。这导致大量美国飞机需要飞到目标能够目视识别的距离才能发动攻击，失去了超视距作战的意义。这条准则也被世界上其他国家所遵守，直接导致了“麻雀”时代的黯然落幕。
80年代以后，凭借先进的计算机技术，敌我识别技术也开始得到迅速发展，这也得益于整个航空工业的规范化。先进的敌我识别系统仍然采用应答式，不过这种应答式和早期简单一对一对暗号的方式不同，其分别针对民用信道、军用信道和特殊电子信道发射一大批打包信号，里面甚至包括敌方应答机的询问信号和编码。根据对目标应答回复信号进行分析，可以直接辨认出民用飞行器、己方飞行器和敌方飞行器，以及少量不可辨识的飞行器等类别。在可辨认的飞行器中，识别系统可以根据计算机存储库的ID编码识别库准确辨认出飞机类型，甚至可以准确到具体的哪一架飞机。对不能辨识的目标，它按照对方应答器回复的信号类型先将其识别为敌机、友机或者不明目标，也可以通过战区战术信息分发，从预警雷达处获知目标的敌我属性，并将其标列出来，同时记录目标所发出的询问或者识别信号，将其特征进行自定义并存储下来。