鉴定亲子关系用得最多的是DNA分型鉴定。人的血液、毛发、唾液、口腔细胞及骨头等都可以用于亲子鉴定，十分方便。
根据国家规定，做亲子鉴定需要填写司法鉴定书。司法鉴定书具有法律效力，能够被法院、司法机关、律师事务所认可。然后填写《DNA委托鉴定申请表》和《委托书》，采集血液或血痕样品，才能进入DNA检测程序。
原理
ABO血型鉴定的原理是根据红细胞上有或无A抗原或/和B抗原，将血型分为A型、B型、AB型及O型四种。可利用红细胞凝集试验，通过正(血清试验)反(细胞试验)定型准确鉴定ABO血型。所谓正定型是用已知抗A和抗B分型血清来测定红细胞上有无相应的A抗原或/和B抗原，所谓反定型是用已知A细胞和B细胞来测定血清中有无相应的抗A或抗B。
亲代：A型+A型，子代可能：A型、O型，子代不可能：B型、AB型
亲代：B型+A型，子代可能：A型、B型、AB型、O型，子代不可能：无
亲代：B型+B型，子代可能：B型、O型，子代不可能：A型、AB型
亲代：一方或双方是AB型，子代可能：A型、B型、AB型，子代不可能：O型
亲代：A型+O型，子代可能：A型、O型，子代不可能：B型、AB型
亲代：B型+O型，子代可能：B型、O型，子代不可能：A型、AB型
亲代：O型+O型，子代可能：O型，子代不可能：A型、B型、AB型
注释：血型鉴定不能作为是否具有亲缘关系的标准，只有DNA亲子鉴定，才是确定是否具有亲缘关系的黄金标准。
1.户口申报中亲生血缘关系鉴定
2.离婚、财产继承案中的亲生血缘关系鉴定
3.婴儿错抱案、拐卖儿童案中身份的鉴定
4.移民案中有关人员的亲缘关系鉴定
5.侵犯致孕案中确定胎儿的亲生父亲
6.其他一些需要确认争议个体间亲缘关系的鉴定胎儿DNA亲子鉴定“胎儿亲子鉴定”是指利用基因技术鉴定胎儿遗传意义上的父亲，当胎儿遗传意义上的父亲是谁不得而知时，“胎儿亲子鉴定”可从孕妇的羊水中提取细胞，通过鉴定胎儿的DNA(脱氧核糖核酸)确认父子关系。一般在怀孕10-13周可以做绒毛活检，怀孕16周以上,可以做羊水鉴定。一定要选择三甲妇科医院，医生会在B超全程检测下施行。绒毛活检只有上海和北京的个别医院可以操作。做胎儿鉴定，都是不会影响到胎儿的正常发育，更不会造成胎儿畸形。
7.因车祸丧生的无名*认领，需要确定亲缘关系
8.非婚生育的子女或者是超生的子女需要上户口，需要先确定亲子关系
做DNA亲子鉴定,两人鉴定,还是三人鉴定好
父亲、母亲、孩子三人都参加鉴定，是完整的DNA亲子鉴定，因为三联体鉴定较单亲鉴定有更高的精确率，往往可以达到99.9999%或则更高。同时也可以避免由于当初医院抱错、出生时弄错等等情况。
从技术上来讲,父子或母子二人DNA亲子鉴定鉴定,也完全能达到要求。但父子或父女DNA亲子鉴定，有1.4%可能的基因突变,这种情况，如是父子鉴定，可增加母亲样本或加做Y基因检测，同样可以准确的结果。如是父女鉴定，则只有增加母亲的样本才可检测出来。
另外，做父子鉴定，还要认真回忆，在孩子出生的时候，有没有医院抱错的情况。在工作中经常遇到，父子鉴定没有亲缘关系，闹到法院后，做父母子三人鉴定，母子也没有亲缘关系，原是医院抱错了。
DNA指纹
DNA指纹指具有完全个体特异的dna多态性，其个体识别能力足以与手指指纹相媲美，因而得名。可用来进行个人识别及亲权鉴定，同人体核DNA的酶切片段杂交，获得了由多个位点上的等位基因组成的长度不等的杂交带图纹，这种图纹极少有两个人完全相同，故称为"DNA指纹"。
由于DNA指纹图谱具有高度的变异性和稳定的遗传性，且仍按简单的孟德尔方式遗传，成为目前最具吸引力的遗传标记，可广泛用于亲子鉴定。
特点：1.高度的特异性：研究表明，两个随机个体具有相同DNA图形的概率仅3×10^-11;如果同时用两种探针进行比较，两个个体完全相同的概率小于5×10^-19。全世界人口约50亿，即5×10^9。因此，除非是同卵双生子女，否则几乎不可能有两个人的DNA指纹的图形完全相同。2.稳定的遗传性：DNA是人的遗传物质，其特征是由父母遗传的。分析发现，DNA指纹图谱中几乎每一条带纹都能在其双亲之一的图谱中找到，这种带纹符合经典的孟德尔遗传规律，即双方的特征平均传递50%给子代。3.体细胞稳定性：即同一个人的不同组织如血液、肌肉、毛发、精液等产生的DNA指纹图形完全一致。
STR检测
短串联重复序列(shorttandemrepeat，STR)又称微卫星DNA(microsatelliteDNA)，是一类广泛存在于人类基因组中的DNA多态性基因座。它由2~6碱基对构成核心序列，呈串联重复排列。STR基因位点长度一般在100～300bp之间.因个体间DN*断长度或DNA序列差异而成高度多态性，在基因传递过程中遵循孟德尔共显性方式遗传。因其基因片段短、扩增效率高、判型准确等特点，被称作第二代DNA指纹，近几年亲子鉴定多采用该方法。
SNP
SNP成为第三代遗传标志,人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关。
RFLP分析
限制图谱标记和可见表型重组频率是可测量的，将遗传图谱分为基因型和表型两种分子标记。限制标记成为分子水平上测定遗传基因的有力工具，也是因为它不受对表型有影响的基因组变化。
rflp和snp是连锁图谱的基础，对于亲子鉴定具有重要的意义。许多使人致病的遗传性疾病我们可以知道它在遗传图谱的哪一个位置，但是还不知其对应的基因序列或者蛋白质，如囊性纤维化病符合孟德尔遗传规律但是在该基因被标注前，其突变体的分子本质是不知的。病人和正常人的dna限制图谱的比较中，我们常发现其基因组中出现或者缺失特定的限制位点。如果一个限制性标记与某个表型特征相连锁，则该限制位点定位在该表性特征基因附近。鉴定出该标记具有以下两种意义：提供了诊断疾病的程序;为基因的分离提供了参考。
人类基因组频繁出现snp，这对于绘制遗传图谱是有帮助的。我们可以根据snp的数量推断出人类基因组中每一千到两千个碱基就有一个snp。对于遗传疾病的基因的鉴定，就可以通过对最近的snp对其进行快速定位。
同样，rflp应用到遗传定位中，我们可以检测未知位点与多态性片段的关系来定位。
rflp的出现为亲子鉴定的精确技术提供了基础。对比父母和子女的染色体适当位置的rflp图谱，就可以精确判断其亲缘关系。
鉴定亲子关系目前用得最多的是DNA分型鉴定。人的血液、毛发、唾液、口腔细胞等都可以用于用亲子鉴定，十分方便。一个人有23对(46条)染色体，同一对染色体同一位置上的一对基因称为等位基因，一般一个来自父亲，一个来自母亲。如果检测到某个DNA位点的等位基因，一个与母亲相同，另一个就应与父亲相同，否则就存在疑问了。
DNA亲子鉴定步骤如下：
第一步：DNA提取
把样本细胞核中所含有DNA提取出来，然后进行一定的纯化，化除样本中的杂质。
第二步：PCR扩增
PCR的中文名为聚合酶链式反应，简单的说，PCR扩增这一步就是把我们所需要的片段通过酶促反应，在PCR仪上进行大量复制，放大到通过某些专用仪器可以看到的程度。
第三步：后PCR反应
这一步主要是上测序仪检测的准备阶段，将双链的DNA打开，加一些检测用的的内标，主要是用来标记检测的片段长度。
第四步：毛细管测序仪检测
第五步：分析数据，出具报告
主要是检测人员将所得结果进行分析汇总、计算，然后出鉴定结论和报告。