病原微生物宏基因组检测

感染性疾病是指因细菌、病毒、真菌、支原体等病原体病毒侵入,引发的身体局部组织发生损伤性病变和全身炎症反应。感染性疾病已成为当今世界严重威胁人类健康的重大疾病。据2018年WHO公布数据显示,感染性疾病在全球10大致死原因中占据重要位置,中等及低收入国家中,30-50%以上死亡由感染性疾病造成。在中国,感染性疾病占所有疾病的50%以上,75%造血系统肿瘤患者50%实体肿瘤患者死于感染,脓毒症(严重感染)患者死亡率高达50%。在临床上,超过2/3的感染性疾病最终仍无法鉴定其病原体,导致临床不能针对性地用药,经验试错情况时有发生。这一困境在临床重症感染性疾病,特别是由疑难、罕见的病原体导致的临床重症型病例上尤其严峻,快速、准确的诊断是有效治疗、病情监测和控制疾病蔓延的重要前提。

高通量测序平台

阿吉安生物基于行业领先高通量测序平台,结合阿吉安自建微生物数据库PathoSeq?DB及专利算法,在宏基因组测序技术基础上开发了新型病原微生物产品PathoSeq?。

PathoSeq?可对临床样本中所有病原微生物进行全面检测,快速、准确获取病原微生物种属信息和耐药基因信息。PathoSeq?产品旨在为每一份临床样本提供病原学证据支持,协助临床医生快速制定诊疗方案,辅助临床精准抗感染。

本地化实验室,从收样到专业检测报告出具仅需24h。

多样品处理技术:保障复杂样本提取效率;

双重破壁技术:有效提高真菌、胞内菌破壁效率,保障病原检出率;

DNA+RNA同步建库技术:适应珍贵样品,检测更精准。

PathoSeq?核心算法及数据库:双算法引擎,三级数据库,交叉验证,结果科学可靠。

专业医学报告解读团队:从数据/临床信息/文献及案例等多维度进行专业解读;

执业医师团队为临床提供建议咨询。

疑“难”传统微生物检测反复阴性且治疗效果不佳;长期不明原因发热,感染原因不明等

“新”发疑似新发病原体、临床上提示可能有一定的传染性。

危“重”病情危重,需要尽快明确病原体:脓毒症、重症肺炎、脑膜炎等。

特“殊”特殊病人如器官移植、免疫缺陷人群等。

呼吸系统感染

送样类型(呼吸系统)肺泡灌洗液/肺穿刺>痰液>咽拭子>外周血

中枢神经系统感染

送样类型(中枢神经系统感染)脑脊液/外周血*怀疑细菌性脑膜炎可同时送检血液样本

血流感染

送样类型(血流感染)外周血

细菌性胸膜炎感染

送样类型(细菌性胸膜炎)胸水

骨和关节感染

送样类型(骨和关节感染)关节积液、骨髓

泌尿系统感染

送样类型(泌尿系统感染)清洁中段尿、导尿管采集尿液、耻骨上膀胱穿刺创面样本拭子、创面

皮肤/软组织感染

送样类型(皮肤、软组织感染)组织样本、脓肿液

感染部位不明

送样类型(感染部位不明确情况)外周血

DNA检测

怀疑DNA病原体感染时,如细菌、真菌、DNA病毒、寄生虫、支原体/衣原体。

RNA检测

怀疑RNA病毒时,如流感病毒、冠状病毒、丙肝病毒、肠道病毒等。

DNA+RNA检测

胞内寄生菌,如分枝杆菌;无法排除病毒感染类型,建议同时送检DNA+RNA。

THE END
1.PMSeq?病原微生物高通量基因检测PMSeq?病原微生物高通量基因检测 对感染标本直接进行高通量测序,通过微生物专用数据库比对和智能化算法分析,获得疑似致病微生物的种属信息,并提供全面深入的报告,为疑难危重感染提供快速精准诊断依据,促进抗生素的合理作用。 根据提取核酸的https://mb.mituo.cn/mui584/product/showproduct.php?id=10
2.高通量测序平台mNGS病原微生物检测 Q-mNGS?定量宏基因组检测 ——更快、更真、更准的新一代 mNGS 技术 相比传统 mNGS,Q-mNGS?实现了人源和病原体核酸的相对定量检测,可溯源样本中病原及人源核酸的真实比例,实现真/假阴性的区分和治疗效果的监测。13 小时极速完成标本到报告全流程。 https://www.terramed.cn/business_detail/14
3.一种MALDITOF毛细管电泳法虽然在自动化程度和分析时间上有了较大提升,但其检测通量远低于近年来新兴的分子生物学检测手段。高通量测序(ngs)能一次对几十万到几百万条dna分子进行序列测定,在临床病原菌检测中发挥重要作用,但是ngs技术对设备要求高、技术门槛高、平台构建需要大量资金投入,难以在临床应用领域进行推广。因此,临床应用...https://www.xjishu.com/zhuanli/27/202110576512.html
1.pmseq?病原微生物高通量基因检测PMseq?病原微生物高通量基因检测 对感染标本直接进行高通量测序,通过微生物专用数据库比对和智能化算法分析,获得疑似致病微生物的种属信息,并提供全面深入的报告,为疑难危重感染提供快速精准诊断依据,促进抗生素的合理作用。 根据提取核酸的种类不同,分为DNA检测流程和RNA检测流程。DNA检测流程适用于胞内寄生的细菌如结...https://www.genomics.cn/medical-PMSeq.html
2.学协会:高通量宏基因组测序技术检测病原微生物的临床应用规范化...2.靶向基因测序:基于高通量测序技术的病原微生物检测,除无偏倚的mNGS外,还包括原核生物的16S rRNA基因、真菌(5S rRNA基因两端的ITS1、ITS2及25-28S rRNA基因中的D1及D2区等)以及特定病原微生物靶基因等[17]。如怀疑沙眼衣原体可选momp(主要外膜蛋白基因),怀疑结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)可选...https://jsp.365heart.com/detail/9E162530-5B77-4B83-A6CD-88D52BEFC3D5
3.指南与共识高通量宏基因组测序技术检测病原微生物的临床应用...宏基因组下一代测序(mNGS)技术直接针对标本中核酸无偏倚检测病原微生物序列。但是,mNGS需经标本前处理、核酸提取、文库制备、上机测序、数据库比对、报告生成及结果解读等一系列过程,对技术平台及人员素质要求较高。为规范mNGS技术在感染性疾病诊断中的应用,提高危急重症、疑难感染性疾病和新发突发传染病的救治水平,在...https://www.hainmc.edu.cn/ecmd/info/1471/10704.htm
4.华大基因PTseq呼吸道感染病原微生物靶向高通量基因检测上市基于病原微生物高通量基因测序领域十年产品技术研发和五年临床转化经验,华大基因全新打造PTseqTM呼吸道感染病原微生物靶向高通量基因检测产品。 该产品依托国产自主测序平台、专利引物设计系统及独有污染校正算法,基于tNGS技术进行检测,同时具备测序技术的广谱性优势和多重PCR技术的高灵敏度优势,兼具检测性能与高性价比,检...https://www.bgi.com/news/2023082401
5.感染疾病筛查之病原微生物宏基因组测序(mNGS)宏基因检查全称病原微生物宏基因组测序,是一种二代核酸测序技术,通过检测标本中所有病原体包括细菌、真菌、病毒等微生物的DNA,RNA等遗传物质,进行高通量测序,基于生物信息学算法,与临床病原数据库进行比对分析,鉴定样本中病原微生物种类及功能信息,来判断是何种病原体感染导致疾病的产生。是一种新型的基因水平的检测...https://www.hkdyfy.cn/info/3672/23620.htm
6.华大基因PMseq?病原微生物高通量基因检测可一次性检测上万种病...这一体系旨在为科学决策提供依据,通过加强微生物耐药监测与报告,及时掌握微生物耐药情况,从而制定和调整防控策略,以遏制微生物耐药的发展与扩散。在此背景下,针对微生物的耐药机制,华大基因推出PMseq?病原微生物高通量基因检测,PMseq?病原微生物高通量基因检测对混合感染具有很强的识别能力,且在耐药方面,PMseq?...https://www.zealer.com/detail/1559272
7.病原微生物高通量测序检测CTI华测检测医学实验室按照国家卫生健康委员会、ISO15189及CAP等法规和标准设立,采用国际知名研究机构的先进管理体系,与全球顶尖医学检验机构开展广泛合作,为您提供医学检测相关的病原微生物高通量测序检测服务。 咨询报价 关键字 基因检测 感染源筛查 病原体筛查 ...https://www.cti-cert.com/service/17138/17877.html
8.病原体检测技术详解行业新闻新闻中心等温扩增支原体检测近年来发展起来的病原微生物高通量检测技术样本需要量少、快速省时、无污染、诊断结果精确、自动化程度高,相信随着研究的不断进展和深入,这些高通量诊断技术和方法必将在病原微生物的诊断分析方面起到越来越重要的作用,而多种检测技术的联合和综合更是有着广阔的应用前景。https://www.gendx.cn/article.php?id=137
9.成人呼吸道感染病原诊断核酸检测技术临床应用专家共识(2023)@MedSci病原体的快速检测和准确诊断是感染性疾病有效治疗的重要前提,但仅依靠传统微生物学及免疫学技术,近70%的患者无法明确病原学诊断[3]。 近年来,随着病原体单靶标聚合酶链反应(PCR)、以症候群为基础的病原体多重PCR技术、微流控芯片技术、数字PCR技术、宏基因组高通量测序(mNGS)技术以及多重病原靶向测序(tNGS)...https://m.medsci.cn/article/show_article.do?id=964be9198375
10....500基因肿瘤高通量基因测序20参照国家发展计划委员会(计价格[2002]1980号)《招标代理服务收费管理暂行办法》规定的收费标准,由中标人须向招标代理机构缴纳中标服务费。以费率或单价进行报价的项目,计费基数为预算金额。 七、公告期限 自本公告发布之日起1个工作日。 八、其它补充事宜 http://www.ccgp-beijing.gov.cn/xxgg/sjzfcggg/sjzbjggg/t20220516_1426742.html
11.靶向第二代测序技术在病原体检测中的作用https://www.hanspub.org/journal/acm https://doi.org/10.12677/acm.2024.141101 靶向第二代测序技术在病原体检测中的作用 罗宁*,何泰瑜,康娟,张大志# 重庆医科大学附属第二医院感染科,重庆医科大学感染性疾病分子生物学教育部重点实验室,重庆医科 大学病毒性肝炎研究所,重庆 收稿日期:2023年12月17日;录用日期...https://www.hanspub.org/journal/PaperDownload.aspx?paperID=79347
12.临床NGS数据中的病原微生物检测病原高通量检测技术,基于宏基因组“撒网式”的检测方法,通过微生物专用数据库比对和智能化算法分析,全面覆盖真菌、细菌、病毒、寄生虫等病原微生物,针对疑似危重或不同感染症候群,可以快速实现感染性疾病的精确诊断。 诚然,基于高通量测序技术的病原菌具有其显著的优势 ...https://www.yunbios.net/detection-of-microorganisms_in_clinicalNGSdata.html