青岛市疾病预防控制中心高通量基因测序仪(含配套试剂耗材)采购需求
1、项目概况:高通量基因测序仪(含配套试剂耗材)采购项目
2、本项目预算金额:本项目预算金额为15400000.00元。资
3、采购人信息:
名称:青岛市疾病预防控制中心
地址:青岛市山东路175号
联系方式:0532-85650290
二、采购需求
1.项目说明
1.1本章内容是根据采购项目的实际需求制定的。
地方标准或者其他标准、规范,中标人供货时应当提供有关货物的
合格证明材料等。
1.3投标人应保证货物是全新、未使用过的合格产品。并完全符
合合同规定的质量、规格和性能的要求。中标人应保证所提供的货
物经正确安装、正常运转和保养后,在其使用寿命期内应具有满意
的性能。在货物质量保证期内卖方应对由于设计、工艺或者材料的
缺陷而发生的任何不足或者故障负责。所投产品应提供详细的技术
资料,应有检测报告等详细资料。
2
1.4进口产品是指通过中国海关报关验放进入中国境内且产自
关境外的产品。
政府采购应当采购本国产品。采购人确需招标采购进口产品的,
应在招投标活动开始前,按照财政部《政府采购进口产品管理办法》
(财库〔2007〕119号)文件规定办理审核手续,通过财政部门审核
后,方可招标采购进口产品,否则采购人不得招标采购进口产品,
投标人不得提供直接进口或者委托进口产品(包括已进入中国境内
的进口产品)。
采购人或采购代理机构在采购进口产品时不得拒绝国产相同质
量产品的制造商或代理商参与投标。
2.招标产品技术规格、要求和数量(包括附件、图纸等)
详见附录1。
附录1:
序号货物名称技术参数单位数量备注
1高通量基因测序仪详见“采购明细详细内容附件”序号1-7项要求套2
单价采购预算及最高限价:¥570.01万元/台
2高通量基因测序仪配套详见“采购明细详细内容附批1
采购预算及最高限
3试剂耗材件”序号8项要求价:¥399.98万元)
采购明细详细内容附件:
序号设备参数要求
1整体要求
1.1设备用途:适用于新型冠状病毒肺炎、不明原因肺炎、
不明原因感染等突发和新发公共卫生事件的快速应对,
快速检测致病源;适用于微生物全基因组测序、全外显
子测序、转录组测序、全基因组小RNA测序、靶向测序、
微生物宏基因组分析、病毒基因组变异研究、甲基化研
究等。
1.2满足自动化、高通量测序需求。
2技术参数
★2.1数据通量:主机测序每次反应测序数据产出量最高可达
300Gb。
2.2高通量测序平台数据读取模式:单端读取序列和双端读
取序列。
2.3测序原理:采用光学原理的基于可逆终止子边合成边测
序技术,使用荧光信号确认碱基种类,每次只读取一个
4
碱基,保证最终的核酸序列质量。
2.4新冠捕获技术原理:采用多重PCR技术获得新冠病毒的
基因组全长,获得产物直接用于二代和三代基因组测序,
分析新冠病毒全长。
2.5适用的样本类型:鼻咽拭子、灌洗液、胸积水、脑脊液、
全血、血清、血浆、尿液、粪便、石蜡包埋蜡块、纯培
养的细菌、病毒和寄生虫、环境标本等。
2.6新冠全基因组序列采用PCR技术,全部捕获需不超过3
小时完成。
2.7提供未知病原检测RNA建库方案,RNA起始量≦500pg;
起始量≦1ng。
2.8平台数据读长:单端读取序列,读长至少包括50bp、100bp
和150bp;双端读取序列,读长至少包括2×50bp、
2×100bp和2×150bp。
2.11不同样品并行性:提供≥380个样品的index(条码)混
合接头。
2.12样本和芯片加载便利性:无需任何样本加载系统、无需
任何装载系统。
2.13实验过程生物安全性:整个设备实验过程封闭,无人员
5
接触,无废液、废气外排。
★2.14检测突变频率低于0.1%。
2.15测序数据准确性:测序结果给出严格的Q30质量数据,
当2×150bp测序时,Q30值≥75%。
★2.16全基因组测序覆盖度(coverage)≥99%。
2.17测序过程中标签跳跃(IndexHopping)现象≤0.0001%。
2.18测序结束后,不需进行液流流路的冲洗维护,操作简便,
2.19测序系统主机内置服务器,提供同品牌整合在测序仪内
的App版本优化的生物信息学分析软件。
2.20测序仪内置生物信息分析加速器,提供准确的超快速基
因组分析功能,操作系统安全稳定。
3生物信息分析系统
3.1新冠病毒全基因组分析软件模块
3.1.1可对主流的二代测序平台和三代测序平台产生的测序结
果进行新冠病毒全基因组序列分析,具备自动完成新冠
病毒全基因组序列拼接等功能。
3.1.2图形化操作界面,无需命令行输入,从下机数据到结果
报告仅需一键式操作;下机数据自动生成病毒基因组溯
源进化树;用户可以自主添加序列信息,从而生成新的
进化树。
★实现96个样本的批量处理,可对接最新测序平台。
6
3.1.3
3.2流感病毒基因组分析模块
3.2.1从下机数据到结果报告仅需一键式操作。
3.2.2实现96个样本的批量处理,完美对接新一代测序平台。
3.2.3直接识别流感病毒关键位点的变异,区分不同亚型。
3.3未知病原体高通量测序分析软件模块
3.3.1可兼容二代测序和三代测序的下机数据;从下机数据到
结果报告仅需一键式操作。
3.3.2分析2GB大小的测序数据1h内完成分析。
3.3.3数据库包含≥8000种病毒,≥9000种支原体和细菌,
≥1000种真菌和寄生虫。
3.3.4提供结果数据的reads数目做图统计功能,相对reads
做图统计功能,物种树分析功能;提供结果报告图片和
病原拼接序列结果的导出功能,用于未知病原体鉴定。
3.3.5内含≥300种常见病原注释信息,并且用户可自定义加
入病原,用于常见病原的识别。
3.4宏基因组病原鉴定、抗性基因和毒力基因分析软件模块:
可进行毒力基因和耐药基因的鉴定功能,包含KEGG、VFDB
在内的多个数据库。
3.5细菌全基因组拼接和鉴定软件模块
3.5.1具备细菌全基因组拼接功能;可进行进化树分析。
3.5.2可进行毒力基因和耐药基因的鉴定功能,包含KEGG、VFDB
7
3.6数据分析服务器:处理器;内存≥64GB,2400MTs;硬盘
≥16TB7.2KRPMSATA6Gb/S;配置有线鼠标和键盘,
16XDVD-ROMSATA光驱;显示器≥27英寸。
3.7处理器CPU≥十四核二十八线1.7GHZ。
4高通量测序平台数据分析系统
4.1操作系统:支持windows、Mac或linux三种操作系统
之一。
4.2操作界面:可视化操作窗口,无需命令行编程经验,不
需要编写linux命令。
4.3数据识别:支持不同测序平台的数据导入和分析,包括
一代测序数据Sanger平台;二代测序平台数据,如
SOLID、LifeIonTorrent、CompleteGenomics、
Roche454、IlluminaGenomeAnalyzer;三代测序数据,
如PacBio平台。
4.4信息接口:提供下载Hg19或Hg38及其他生物的参考序
列及注释信息的接口。
4.5分析流程:支持创建和修改workflow,实现拓展或自定
义分析流程。
4.6功能模块:可以进行DNA-seq、RNA-seq、Chip-Seq、
Bisulfite、miRNA、Microarray、16S/宏基因组序列拼
接组装、SNP检测、多样本分析、数字基因表达、小RNA
8
分析、标签表达谱、表观基因组学分析、EST文库构建、
系统发育分析、聚类分析等数据分析以及服务器整合和
定制化服务。可实现传统分子生物学分析工具的功能,
如从头组装、引物设计、序列比对、SNP分型、系统发
育树分析、聚类分析等。
4.7结果展示:可以创建GenomeBrowserTrack,可视化查
看分析结果。可以监控、暂停和终止分析过程、记录分
析日志。
4.8微生物插件:配备微生物MicrobialGenomicsModule
插件和GenomeFinishingModule插件,实现宏因组、
微生物组靶标序列和全基因组的多样性、功能及分型研
究。软件及插件可实现每季度进行更新。
4.9批量工作:支持批量上传和批量分析数据。
4.10软件更新和维护:软件基于云端,包含大于六百六十万
条来自私有数据库、公共数据库和文献的记录,每季度
进行数据库和功能的更新。
4.11分析功能:经典通路富集;上游调控因子;因果关系网
络分析;BioProfiler;构建调控机理网络;分子活性预
测;相互作用网络;匹配分析;磷酸化调控分析;microRNA
靶标过滤;转录本分析;比较分析。
4.12搜索功能:可以基于基因、化合物、通路、疾病、功能
对数据库进行插叙;图片处理:可以对通路图,基因,
9
化合物,细胞结构等进行颜色、字体等调整;导出功能:
可以到处数据、表格、图片、通路图。
4.13免费维护5年。
4.14数据分析服务器:处理器至少CPU十四核二十八线1.7
GHZ;内存≥64GB,2400MTs;硬盘≥12TB7.2KRPMSATA
6Gb/S;配置有线鼠标和键盘,16XDVD-ROMSATA光驱;
显示器≥27英寸;
5荧光定量PCR仪
5.
1
通道数:6色激发光滤光片和6色检测光滤光片可
自由组合,最多检测21种不同的荧光光谱。
5.2模块规格:支持4种模块,标准96孔模块;快速96孔
模块;384孔模块;微流体芯片模块;模块可自行更换。
5.3支持耗材:国际标准96孔(0.2mL)反应板与光学盖膜,
0.2mL八连管,0.2mL单管;384孔反应板与光学盖膜,
微流体芯片。
5.4温控模块最大变温速率:≥9.0°C/秒;样本最大变温速
率≥4.8℃/秒;
5.5光学系统:高亮度白光LED光源(寿命>5年),6色激发
滤光片,6色检测滤光片、CMOS成像;
5.6精确数码温控模块:6个独立的精确数码温控区域,可
以同时实现24个可以独立的精确控温的温度设置;
5.7被动参照染料:软件支持Rox荧光校正去除移液误差;
5.8数据同时采集:所有反应孔同时采集荧光数据,不同孔
5.9人脸识别:支持人脸识别功能,自动登入个人账户;
5.10RFID射频识别反应板:RFID智能识别微流体芯片;
5.11内置触摸屏电脑,触摸屏电脑可备份还原超过300次的
实验数据;仪器触摸屏提供一键式的实验方案,可快速
地设置多种应用。
6PCR热循环仪
6.1最大模块变温速率:≥6.0℃/秒;最大样本变温速率:
≥4.4℃/秒
6.2温度范围:0-100.0℃;
6.3≥6组独立控温区域,可精确设置6个不同温度
6.4支持区间温差最大5℃,整体25℃;允许区间最大10℃,
整体30℃;
6.5以太网或Wi-Fi连接网络;
6.6联机操控:无需购买软件,允许多台机器在同一局域网
内相互连接,并设置由其中一台来操控;
6.7采用配套的控制软件,可以集中管理和控制多台不同型
号PCR仪;
6.8内置模拟模式,可模拟主流PCR仪热学性能。
7每套仪器配置要求
7.1满足招标参数的基因测序仪主机:1台;
7.2满足招标参数的测序仪内置操作软件和内置数据分析软
件:1套;
7.396孔板离心机:1台;
7.4满足招标参数的流感病毒生物信息分析模块:1套;
7.5满足招标参数的未知病原分析模块:1套;
7.6满足招标参数的数据分析服务器:2套;
7.7满足招标参数的新冠病毒序列分析模块:1套;
7.8满足招标参数的细菌16S真菌18S全长鉴定和分析软件:
1套;
7.9满足招标参数的毒力基因和耐药基因分析软件:1套;
7.10满足招标参数的细菌全基因组拼接和鉴定分析软件:1
套;
7.11满足招标参数的高通量测序平台数据分析系统:1套;
7.12核酸定量分析仪(含定量试剂2套):1台;
7.1396孔板振荡器:1台;
7.1496孔板磁力架:1台(含5套深孔板);
7.151.5–2mL微量离心管适配16孔磁力架:1台;
7.16新型冠状病毒全基因组捕获、建库、标签、测序等试剂:
7.17满足全基因组测序工作需要的荧光定量PCR仪:1台;
7.18满足全基因组测序工作需要的PCR热循环仪:1台;
7.19数据信息储存系统:2台
8投标人所投高通量基因测序仪配套试剂耗材(采购预算
及最高限价:¥399.98万元)
8.1适用性:用于新型冠状病毒全基因组的扩增捕获、高通
量测序的建库及高通量测序实验,能够准确发现新的变
异、新的毒株,追踪病毒变异情况;
8.2捕获试剂
8.2.1灵敏度:仅需少量RNA(<0.5ng);
8.2.2适合CT值≤33的新冠样本全基因组捕获,捕获效率≥
99%;
8.2.3试剂盒搭配同品牌软件分析,可自动扣除扩增引物序列,
从而鉴定突变位点,识别突变株;
8.3建库试剂
8.3.1能够用于以上新冠捕获产物的建库,建库质量稳定,操
作简单;
8.3.2标签数量≥96种,与测序平台配套;
8.4测序试剂
8.4.1测序试剂盒测序读长:2*150bp;
8.4.2数据产出:至少120G的数据产出;
8.4.3质量分值:Q30≥75%;
8.4.4适用机型:配套测序平台使用。
★8.5数量要求
8.5.1测序仪配套新冠病毒全基因组测序上机前试剂,1530人
份
8.5.2测序仪配套上机试剂盒,3038人份
3.商务条件
★3.1交货期
合同签订后20日内交货并安装调试完毕。
3.2交货地点
招标人指定地点。
★3.3付款方式
合同签订后,进场验收且财政资金到位后,预付预算金额的30%
(¥462万元),安装调试、验收合格后,中标人向招标人支付合同
金额的10%作为质保金并向招标人开具合同金额100%的发票,招标
人自收到发票之日起5个工作日付款至合同金额的100%,质保金待
质保期满后无质量问题一次性无息付清。
3.4验收
3.4.1货物运抵现场后,采购人将对货物数量、质量、规格等进
行检验。如发现货物和规格或者两者都与招标文件、投标文件、合
同不符,采购人有权限根据检验结果要求中标人立即更换或者提出
索赔要求。
3.4.2货物由中标人进行安装,完毕后,采购人应对货物的数量、
质量、规格、性能等进行详细而全面的检验。并提供装订成册的中
文使用说明书、操作手册等资料,验收7日后,证明货物质量无任
何问题,由采购人组成的验收小组签署验收报告,作为付款凭据之
一。
3.5质量保证期
★3.5.1设备质保期:自验收合格之日起1年,国家主管部门或
者行业标准对货物本身有更高要求的,从其规定并在合同中约定,
投标人亦可提报更长的质保期。
★3.5.2配套试剂耗材有效期:自验收合格之日起配套试剂耗材
有效期≥6个月。
3.5.3质量保证期及配套试剂耗材有效期内,如果证实货物是有
缺陷的,包括潜在的缺陷或者使用不符合要求的材料等,中标人应
立即免费维修或者更换有缺陷的货物或者部件,保证达到合同规定
的技术以及性能要求。如果中标人在收到通知后5天内没有弥补缺
陷,采购人可自行采取必要的补救措施,但风险和费用由中标人承
担,采购人同时保留通过法律途径进行索赔的权利。
3.6售后服务
3.6.1中标人应提供及时周到的售后服务,应保证每季度至少一
次上门回访、检修。
3.6.2中标人在接采购人通知1小时做出响应,6小时内到达现
(机)备件。
★3.6.3配套试剂耗材有效期满60日前,中标人免费为招标人
更换同品牌型号的最新批次试剂耗材。
3.6.4中标人免费为采购人提供中文操作手册并培训操作人员,
其中包括讲解产品的结构以及原理、产品的使用以及维护保养,直
至操作人员能够独立的操作使用。
1.《财政部国家发展改革委关于印发〈节能产品政府采购实施
意见〉的通知》(财库〔2004〕185号);
2.《国务院办公厅关于建立政府强制采购节能产品制度的通知》
(国办发〔2007〕51号);
3.《财政部环保总局关于环境标志产品政府采购实施的意见》
(财库〔2006〕90号);
4.《政府采购促进中小企业发展管理办法》(财库〔2020〕46
号);《财政部司法部关于政府采购支持监狱企业发展有关问题的
通知》(财库〔2014〕68号);
5.《关于促进残疾人就业政府采购政策的通知》财库[2017]141
号;
6.其他政府采购制度办法。
本项目采购需求公示期限为3日历天。
五、意见反馈方式
本项目采购需求方案公示期间接受社会公众及潜在供应商的监
督。
请遵循客观、公正的原则,对本项目需求方案提出意见或者建
议,并请于采购需求公示期限结束前将书面意见反馈至采购人或者
采购代理机构,采购人或者采购代理机构应当于公示期满5个工作日
内予以处理。
不满意的,异议供应商可就有关问题通过采购文件向采购人或者采
满意的,异议供应商可以向采购人或同级财政部门提出投诉。