为避免因序列差异造成对后期实验结果的影响,需要对客户提供的原始克隆pGBKT7-GRX进行测序和比对分析。
1.1诱饵验证结果
诱饵克隆pGBKT7-GRX序列正确,可继续进行后续实验。
2、自激活和毒性检测及互作验证
2.1酵母转化方法
(1)将Y2HGold酵母菌种在YPDA平板上划线,30°C培养箱倒置培养3天左右,直到克隆大小为2-3mm
(2)挑取一个酵母克隆于3mL的YPDA培养基中(15mL灭菌的离心管);在30°C摇床振荡培养8h;
(3)吸取5μL至50mLYPDA中(250mL三角瓶),在30°C摇床230-250rpm振荡培养16-20h,直至OD600=0.15-0.3;
(4)室温700g离心5min以收集菌体;
(5)倒去上清并用100mLYPDA重悬酵母;在30°C摇床230-250rpm振荡培养3–5h,至OD600=0.4-0.5;
(6)室温700g离心5min以收集菌体,倒去上清并用60mL无菌去离子水重悬酵母;
(7)室温700g离心5min以收集菌体,倒去上清并用3mL1.1xTE/LiAc溶液重悬酵母;
(8)将重悬液分装为3个1.5mL的离心管;高速离心15s;
(9)倒去上清并将酵母重悬于600μL1.1xTE/LiAc溶液;
(10)按照下表构建反应:
(11)每管反应中加入5μL预变性的CarrierDNA、300μL1xPEG/LiAc溶液,混匀;
(12)每管反应中加入50μL重悬酵母感受态细胞,缓慢混匀;
(13)30°C水浴30min,每10min混匀一次;
(14)每管加入20μLDMSO,混匀;
(15)42°C水浴热激15min,每5min上下颠倒混匀一次;
(16)700g离心5min;
(17)弃掉上清,用0.2mLYPDPlus液体培养基重新悬浮;注:YPDPlus是特别配制的增强转化;这个步骤不使用YPD培养基。
(19)高速离心15s;
(20)弃掉上清,用100μL0.9%NaCl溶液重新悬浮细胞。取10μL重悬液,稀释100x涂平板。
2.2诱饵自激活验证与毒性检测结
(1)阳性对照
图1阳性对照
(2)阴性对照
图2阴性对照
(3)自激活检测结果
图3自激活检测结果
(4)毒性检测
图4SD/-Trp
2.2.1毒性检测与自激活检测结果分析
(1)将诱饵质粒和猎物空载共转化Y2HGold感受态,涂布DDO平板能生长说明重组诱饵质粒成功转入宿主菌且对宿主菌无毒性;
(2)涂布TDO有轻微生长,说明诱饵蛋白有轻微自激活;
(3)涂布QDO不能生长,说明诱饵不能激活ADE2的表达,可用QDOXA进行后续实验;
(4)质粒pGBKT7-GRX转入Y2HGold后,菌落生长情况同pGBKT7空载转化酵母后的一致,表明pGBKT7-GRX质粒对酵母细胞均无毒性。
2.3互作验证结果
图5互作验证结果
2.3.1互作验证结果分析:
(1)将诱饵质粒和猎物质粒共转化Y2HGold感受态,涂布DDO平板能生长说明重组诱饵质粒成功转入宿主菌且对宿主菌无毒性;
(2)涂布TDO和QDO均能生长,说明诱饵蛋白和猎物蛋白能激活HIS3、ADE2的表达,所以诱饵蛋白和猎物蛋白有相互作用。
3、点板验证
挑取验证平板上面的单克隆稀释点板至DDO和QDOXA,点板结果如下:
图6点板验证图片
3.1互作验证结果分析:
(1)点板验证结果与前面验证一致,所有点板组合在DDO上生长正常,阳性对照在QDOXA生长且变蓝,说明阳性对照正常。阴性对照在QDOXA不生长,说明阴性对照正常。
(2)实验组pGBKT7-GRX+pGADT7-MYB、pGADT7-SKIP、pGADT7-NAC、pGADT7-Drought、pGADT7-Bzip75、pGADT7-Bzip68、pGADT7-PC在QDOXA上生长,说明能够激活下游报告基因。
综上所述:诱饵蛋白pGBKT7-GRX与猎物pGADT7-BAM3pGADT7-MYB、pGADT7-SKIP、pGADT7-NAC、pGADT7-Drought、pGADT7-Bzip75、pGADT7-Bzip68、pGADT7-PC之间有相互作用。